TSHZ3

TSHZ3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DMI
Ідентифікатори
Символи	TSHZ3, TSH3, ZNF537, teashirt zinc finger homeobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 614119 MGI: 2442819 HomoloGene: 10835 GeneCards: TSHZ3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • cell projection • growth cone • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • регуляція експресії генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of respiratory gaseous exchange by nervous system process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic • Довготривала потенціація Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57616	243931
Ensembl	ENSG00000121297	ENSMUSG00000021217
UniProt	Q63HK5	Q8CGV9
RefSeq (мРНК)	NM_020856	NM_172298
RefSeq (білок)	NP_065907	NP_758502
Локус (UCSC)	Хр. 19: 31.15 – 31.35 Mb	Хр. 7: 36.4 – 36.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSHZ3 (англ. Teashirt zinc finger homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 081 амінокислот, а молекулярна маса — 118 566.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRRKQQAPR		RAAAYVSEEL		KAAALVDEGL		DPEEHTADGE		PSAKYMCPEK
ELARACPSYQ		NSPAAEFSCH		EMDSESHISE		TSDRMADFES		GSIKNEEETK
EVTVPLEDTT		VSDSLEQMKA		VYNNFLSNSY		WSNLNLNLHQ		PSSEKNNGSS
SSSSSSSSSC		GSGSFDWHQS		AMAKTLQQVS		QSRMLPEPSL		FSTVQLYRQS
SKLYGSIFTG		ASKFRCKDCS		AAYDTLVELT		VHMNETGHYR		DDNHETDNNN
PKRWSKPRKR		SLLEMEGKED		AQKVLKCMYC		GHSFESLQDL		SVHMIKTKHY
QKVPLKEPVT		PVAAKIIPAT		RKKASLELEL		PSSPDSTGGT		PKATISDTND
ALQKNSNPYI		TPNNRYGHQN		GASYAWHFEA		RKSQILKCME		CGSSHDTLQE
LTAHMMVTGH		FIKVTNSAMK		KGKPIVETPV		TPTITTLLDE		KVQSVPLAAT
TFTSPSNTPA		SISPKLNVEV		KKEVDKEKAV		TDEKPKQKDK		PGEEEEKCDI
SSKYHYLTEN		DLEESPKGGL		DILKSLENTV		TSAINKAQNG		TPSWGGYPSI
HAAYQLPNMM		KLSLGSSGKS		TPLKPMFGNS		EIVSPTKNQT		LVSPPSSQTS
PMPKTNFHAM		EELVKKVTEK		VAKVEEKMKE		PDGKLSPPKR		ATPSPCSSEV
GEPIKMEASS		DGGFRSQENS		PSPPRDGCKD		GSPLAEPVEN		GKELVKPLAS
SLSGSTAIIT		DHPPEQPFVN		PLSALQSVMN		IHLGKAAKPS		LPALDPMSML
FKMSNSLAEK		AAVATPPPLQ		SKKADHLDRY		FYHVNNDQPI		DLTKGKSDKG
CSLGSVLLSP		TSTAPATSSS		TVTTAKTSAV		VSFMSNSPLR		ENALSDISDM
LKNLTESHTS		KSSTPSSISE		KSDIDGATLE		EAEESTPAQK		RKGRQSNWNP
QHLLILQAQF		AASLRQTSEG		KYIMSDLSPQ		ERMHISRFTG		LSMTTISHWL
ANVKYQLRRT		GGTKFLKNLD		TGHPVFFCND		CASQIRTPST		YISHLESHLG
FRLRDLSKLS		TEQINSQIAQ		TKSPSEKMVT		SSPEEDLGTS		YQCKLCNRTF
ASKHAVKLHL		SKTHGKSPED		HLLYVSELEK		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, клітинних відростках.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19