HOXB5

HOXB5
Ідентифікатори
Символи	HOXB5, HHO.C10, HOX2, HOX2A, HU-1, Hox2.1, homeobox B5
Зовнішні ІД	OMIM: 142960 MGI: 96186 HomoloGene: 37585 GeneCards: HOXB5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding Клітинна компонента • fibrillar center • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • embryonic skeletal system development • endothelial cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system morphogenesis • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3215	15413
Ensembl	ENSG00000120075	ENSMUSG00000038700
UniProt	P09067	P09079
RefSeq (мРНК)	NM_002147	NM_008268
RefSeq (білок)	NP_002138	NP_032294
Локус (UCSC)	Хр. 17: 48.59 – 48.59 Mb	Хр. 11: 96.19 – 96.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXB5 (англ. Homeobox B5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот, а молекулярна маса — 29 434.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNSFS		GRYPNGPDYQ		LLNYGSGSSL		SGSYRDPAAM		HTGSYGYNYN
GMDLSVNRSS		ASSSHFGAVG		ESSRAFPAPA		QEPRFRQAAS		SCSLSSPESL
PCTNGDSHGA		KPSASSPSDQ		ATSASSSANF		TEIDEASASS		EPEEAASQLS
SPSLARAQPE		PMATSTAAPE		GQTPQIFPWM		RKLHISHDMT		GPDGKRARTA
YTRYQTLELE		KEFHFNRYLT		RRRRIEIAHA		LCLSERQIKI		WFQNRRMKWK
KDNKLKSMSL		ATAGSAFQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Levine M., Rubin G.M., Tjian R. (1984). Human DNA sequences homologous to a protein coding region conserved between homeotic genes of Drosophila. Cell. 38: 667—673. PMID 6091895 DOI:10.1016/0092-8674(84)90261-7
• Galang C.K., Hauser C.A. (1992). Cooperative DNA binding of the highly conserved human Hox 2.1 homeodomain gene product. New Biol. 4: 558—568. PMID 1355360

Див. також

• Хромосома 17