NFKB2

NFKB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A3Q, 2D96, 3DO7, 4OT9
Ідентифікатори
Символи	NFKB2, CVID10, H2TF1, LYT-10, LYT10, NF-kB2, p105, p52, p100, p49/p100, nuclear factor kappa B subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 164012 MGI: 1099800 HomoloGene: 1873 GeneCards: NFKB2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • Bcl3/NF-kappaB2 complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • germinal center formation • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • transcription, DNA-templated • follicular dendritic cell differentiation • response to lipopolysaccharide • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4791	18034
Ensembl	ENSG00000077150	ENSMUSG00000025225
UniProt	Q00653	Q9WTK5
RefSeq (мРНК)	NM_001077494 NM_001261403 NM_001288724 NM_002502 NM_001322934 NM_001322935	NM_001177369 NM_001177370 NM_019408
RefSeq (білок)	NP_001070962 NP_001248332 NP_001275653 NP_001309863 NP_001309864 NP_002493	NP_001170840 NP_001170841 NP_062281
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.39 – 102.4 Mb	Хр. 19: 46.29 – 46.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFKB2 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 900 амінокислот, а молекулярна маса — 96 749.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESCYNPGLD		GIIEYDDFKL		NSSIVEPKEP		APETADGPYL		VIVEQPKQRG
FRFRYGCEGP		SHGGLPGASS		EKGRKTYPTV		KICNYEGPAK		IEVDLVTHSD
PPRAHAHSLV		GKQCSELGIC		AVSVGPKDMT		AQFNNLGVLH		VTKKNMMGTM
IQKLQRQRLR		SRPQGLTEAE		QRELEQEAKE		LKKVMDLSIV		RLRFSAFLRA
SDGSFSLPLK		PVISQPIHDS		KSPGASNLKI		SRMDKTAGSV		RGGDEVYLLC
DKVQKDDIEV		RFYEDDENGW		QAFGDFSPTD		VHKQYAIVFR		TPPYHKMKIE
RPVTVFLQLK		RKRGGDVSDS		KQFTYYPLVE		DKEEVQRKRR		KALPTFSQPF
GGGSHMGGGS		GGAAGGYGGA		GGGGSLGFFP		SSLAYSPYQS		GAGPMGCYPG
GGGGAQMAAT		VPSRDSGEEA		AEPSAPSRTP		QCEPQAPEML		QRAREYNARL
FGLAQRSARA		LLDYGVTADA		RALLAGQRHL		LTAQDENGDT		PLHLAIIHGQ
TSVIEQIVYV		IHHAQDLGVV		NLTNHLHQTP		LHLAVITGQT		SVVSFLLRVG
ADPALLDRHG		DSAMHLALRA		GAGAPELLRA		LLQSGAPAVP		QLLHMPDFEG
LYPVHLAVRA		RSPECLDLLV		DSGAEVEATE		RQGGRTALHL		ATEMEELGLV
THLVTKLRAN		VNARTFAGNT		PLHLAAGLGY		PTLTRLLLKA		GADIHAENEE
PLCPLPSPPT		SDSDSDSEGP		EKDTRSSFRG		HTPLDLTCST		KVKTLLLNAA
QNTMEPPLTP		PSPAGPGLSL		GDTALQNLEQ		LLDGPEAQGS		WAELAERLGL
RSLVDTYRQT		TSPSGSLLRS		YELAGGDLAG		LLEALSDMGL		EEGVRLLRGP
ETRDKLPSTA		EVKEDSAYGS		QSVEQEAEKL		GPPPEPPGGL		CHGHPQPQVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Schmid R.M., Perkins N.D., Duckett C.S., Andrews P.C., Nabel G.J. (1991). Cloning of an NF-kappa B subunit which stimulates HIV transcription in synergy with p65. Nature. 352: 733—736. PMID 1876189 DOI:10.1038/352733a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liptay S., Schmid R.M., Nabel E.G., Nabel G.J. (1994). Transcriptional regulation of NF-kappa B2: evidence for kappa B-mediated positive and negative autoregulation. Mol. Cell. Biol. 14: 7695—7703. PMID 7969113 DOI:10.1128/MCB.14.12.7695
• Li Z., Nabel G.J. (1997). A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription. Mol. Cell. Biol. 17: 6184—6190. PMID 9315679 DOI:10.1128/MCB.17.10.6184
• Heusch M., Lin L., Geleziunas R., Greene W.C. (1999). The generation of nfkb2 p52: mechanism and efficiency. Oncogene. 18: 6201—6208. PMID 10597218 DOI:10.1038/sj.onc.1203022
• Betts J.C., Nabel G.J. (1996). Differential regulation of NF-kappaB2(p100) processing and control by amino-terminal sequences. Mol. Cell. Biol. 16: 6363—6371. PMID 8887665 DOI:10.1128/MCB.16.11.6363

Див. також

• Хромосома 10