Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
KLF15
Ідентифікатори
Символи
KLF15 , KKLF, Kruppel-like factor 15, Kruppel like factor 15
Зовнішні ІД
OMIM : 606465 MGI: 1929988 HomoloGene: 8553 GeneCards: KLF15
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• регуляція експресії генів • glomerular visceral epithelial cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of peptidyl-lysine acetylation • glial cell differentiation • cardiac muscle hypertrophy in response to stress • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of glucose import • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular glucose homeostasis • response to insulin • cellular response to peptide
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 126.34 – 126.36 Mb
Хр. 6: 90.44 – 90.45 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF15 (англ. Kruppel like factor 15 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот , а молекулярна маса — 43 992[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVDHLLPVDE NFSSPKCPVG YLGDRLVGRR AYHMLPSPVS EDDSDASSPC
SCSSPDSQAL CSCYGGGLGT ESQDSILDFL LSQATLGSGG GSGSSIGASS
GPVAWGPWRR AAAPVKGEHF CLPEFPLGDP DDVPRPFQPT LEEIEEFLEE
NMEPGVKEVP EGNSKDLDAC SQLSAGPHKS HLHPGSSGRE RCSPPPGGAS
AGGAQGPGGG PTPDGPIPVL LQIQPVPVKQ ESGTGPASPG QAPENVKVAQ
LLVNIQGQTF ALVPQVVPSS NLNLPSKFVR IAPVPIAAKP VGSGPLGPGP
AGLLMGQKFP KNPAAELIKM HKCTFPGCSK MYTKSSHLKA HLRRHTGEKP
FACTWPGCGW RFSRSDELSR HRRSHSGVKP YQCPVCEKKF ARSDHLSKHI
KVHRFPRSSR SVRSVN
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші