SOX15

SOX15
Ідентифікатори
Символи	SOX15, SOX20, SOX26, SOX27, SRY-box 15, SRY-box transcription factor 15
Зовнішні ІД	OMIM: 601297 MGI: 98363 HomoloGene: 74586 GeneCards: SOX15
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • Цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of myoblast proliferation • Диференціація клітин • male gonad development • regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration • negative regulation of striated muscle tissue development • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • positive regulation of G0 to G1 transition • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • chromatin organization • myoblast development • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • central nervous system development • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6665	20670
Ensembl	ENSG00000129194	ENSMUSG00000041287
UniProt	O60248	P43267
RefSeq (мРНК)	NM_006942	NM_009235
RefSeq (білок)	NP_008873	NP_033261
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.59 – 7.59 Mb	Хр. 11: 69.66 – 69.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX15 (англ. SRY-box 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот, а молекулярна маса — 25 251.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALPGSSQDQ		AWSLEPPAAT		AAASSSSGPQ		EREGAGSPAA		PGTLPLEKVK
RPMNAFMVWS		SAQRRQMAQQ		NPKMHNSEIS		KRLGAQWKLL		DEDEKRPFVE
EAKRLRARHL		RDYPDYKYRP		RRKAKSSGAG		PSRCGQGRGN		LASGGPLWGP
GYATTQPSRG		FGYRPPSYST		AYLPGSYGSS		HCKLEAPSPC		SLPQSDPRLQ
GELLPTYTHY		LPPGSPTPYN		PPLAGAPMPL		THL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Goze C., Poulat F., Berta P. (1993). Partial cloning of SOX-11 and SOX-12, two new human SOX genes.. Nucleic Acids Res. 21: 2943 — 2943.  PubMed DOI:10.1093/nar/21.12.2943
• Vujic M., Rajic T., Goodfellow P.N., Stevanovic M. (1998). cDNA characterization and high resolution mapping of the human SOX20 gene.. Mamm. Genome 9: 1059 — 1061.  PubMed DOI:10.1007/s003359900925
• Meyer J., Wirth J., Held M., Schempp W., Scherer G. (1996). SOX20, a new member of the SOX gene family, is located on chromosome 17p13.. Cytogenet. Cell Genet. 72: 246 — 249.  PubMed

Див. також

• Хромосома 17