TAF2

TAF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF2, CIF150, MRT40, TAF2B, TAFII150, TATA-box binding protein associated factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604912 MGI: 2443028 HomoloGene: 31137 GeneCards: TAF2
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TFIID-class transcription factor complex binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • transcription factor TFTC complex • transcription factor TFIID complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1904578 response to organic cyclic compound • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • G2/M transition of mitotic cell cycle • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6873	319944
Ensembl	ENSG00000064313	ENSMUSG00000037343
UniProt	Q6P1X5	Q8C176
RefSeq (мРНК)	NM_003184	NM_001081288 NM_177040
RefSeq (білок)	NP_003175	NP_001074757
Локус (UCSC)	Хр. 8: 119.73 – 119.83 Mb	Хр. 15: 54.88 – 54.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF2 (англ. TATA-box binding protein associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 199 амінокислот, а молекулярна маса — 136 971.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLTGVEPAR		MNRKKGDKGF		ESPRPYKLTH		QVVCINNINF		QRKSVVGFVE
LTIFPTVANL		NRIKLNSKQC		RIYRVRINDL		EAAFIYNDPT		LEVCHSESKQ
RNLNYFSNAY		AAAVSAVDPD		AGNGELCIKV		PSELWKHVDE		LKVLKIHINF
SLDQPKGGLH		FVVPSVEGSM		AERGAHVFSC		GYQNSTRFWF		PCVDSYSELC
TWKLEFTVDA		AMVAVSNGDL		VETVYTHDMR		KKTFHYMLTI		PTAASNISLA
IGPFEILVDP		YMHEVTHFCL		PQLLPLLKHT		TSYLHEVFEF		YEEILTCRYP
YSCFKTVFID		EAYVEVAAYA		SMSIFSTNLL		HSAMIIDETP		LTRRCLAQSL
AQQFFGCFIS		RMSWSDEWVL		KGISGYIYGL		WMKKTFGVNE		YRHWIKEELD
KIVAYELKTG		GVLLHPIFGG		GKEKDNPASH		LHFSIKHPHT		LSWEYYSMFQ
CKAHLVMRLI		ENRISMEFML		QVFNKLLSLA		STASSQKFQS		HMWSQMLVST
SGFLKSISNV		SGKDIQPLIK		QWVDQSGVVK		FYGSFAFNRK		RNVLELEIKQ
DYTSPGTQKY		VGPLKVTVQE		LDGSFNHTLQ		IEENSLKHDI		PCHSKSRRNK
KKKIPLMNGE		EVDMDLSAMD		ADSPLLWIRI		DPDMSVLRKV		EFEQADFMWQ
YQLRYERDVV		AQQESILALE		KFPTPASRLA		LTDILEQEQC		FYRVRMSACF
CLAKIANSMV		STWTGPPAMK		SLFTRMFCCK		SCPNIVKTNN		FMSFQSYFLQ
KTMPVAMALL		RDVHNLCPKE		VLTFILDLIK		YNDNRKNKFS		DNYYRAEMID
ALANSVTPAV		SVNNEVRTLD		NLNPDVRLIL		EEITRFLNME		KLLPSYRHTI
TVSCLRAIRV		LQKNGHVPSD		PALFKSYAEY		GHFVDIRIAA		LEAVVDYTKV
DRSYEELQWL		LNMIQNDPVP		YVRHKILNML		TKNPPFTKNM		ESPLCNEALV
DQLWKLMNSG		TSHDWRLRCG		AVDLYFTLFG		LSRPSCLPLP		ELGLVLNLKE
KKAVLNPTII		PESVAGNQEA		ANNPSSHPQL		VGFQNPFSSS		QDEEEIDMDT
VHDSQAFISH		HLNMLERPST		PGLSKYRPAS		SRSALIPQHS		AGCDSTPTTK
PQWSLELARK		GTGKEQAPLE		MSMHPAASAP		LSVFTKESTA		SKHSDHHHHH
HHEHKKKKKK		HKHKHKHKHK		HDSKEKDKEP		FTFSSPASGR		SIRSPSLSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• Kaufmann J., Ahrens K., Koop R., Smale S.T., Muller R. (1998). CIF150, a human cofactor for transcription factor IID-dependent initiator function. Mol. Cell. Biol. 18: 233—239. PMID 9418870 DOI:10.1128/MCB.18.1.233
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030

Див. також

• Хромосома 8