Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MYOG
Ідентифікатори
Символи
MYOG , MYF4, bHLHc3, myf-4, myogenin (myogenic factor 4), myogenin
Зовнішні ІД
OMIM : 159980 MGI: 97276 HomoloGene: 1854 GeneCards: MYOG
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• cellular response to retinoic acid • positive regulation of myotube differentiation • диференціація клітин • myotube differentiation • negative regulation of glycolytic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lithium ion • осифікація • positive regulation of muscle cell differentiation • response to muscle activity involved in regulation of muscle adaptation • muscle cell fate commitment • cellular response to growth factor stimulus • cellular response to estradiol stimulus • positive regulation of oxidative phosphorylation • muscle organ development • striated muscle atrophy • mRNA transcription by RNA polymerase II • cellular response to magnetism • positive regulation of skeletal muscle fiber development • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • response to gravity • positive regulation of myoblast fusion • positive regulation of muscle atrophy • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of myoblast differentiation • skeletal muscle fiber development • response to electrical stimulus involved in regulation of muscle adaptation • skeletal muscle atrophy • skeletal muscle cell differentiation • response to denervation involved in regulation of muscle adaptation • клітинний цикл • regulation of myoblast fusion • myoblast differentiation • regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation • skeletal muscle tissue development • response to muscle activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to tumor necrosis factor
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 203.08 – 203.09 Mb
Хр. 1: 134.22 – 134.22 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYOG (англ. Myogenin ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот , а молекулярна маса — 25 037[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MELYETSPYF YQEPRFYDGE NYLPVHLQGF EPPGYERTEL TLSPEAPGPL
EDKGLGTPEH CPGQCLPWAC KVCKRKSVSV DRRRAATLRE KRRLKKVNEA
FEALKRSTLL NPNQRLPKVE ILRSAIQYIE RLQALLSSLN QEERDLRYRG
GGGPQPGVPS ECSSHSASCS PEWGSALEFS ANPGDHLLTA DPTDAHNLHS
LTSIVDSITV EDVSVAFPDE TMPN
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , диференціація, міогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші