ZNF217

ZNF217
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HU2, 3UK3, 4F2J, 4IS1
Ідентифікатори
Символи	ZNF217, ZABC1, zinc finger protein 217
Зовнішні ІД	OMIM: 602967 MGI: 2685408 HomoloGene: 4757 GeneCards: ZNF217
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • histone deacetylase complex • клітинне ядро • мітохондрія • nuclear speck • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7764	228913
Ensembl	ENSG00000171940	ENSMUSG00000052056
UniProt	O75362	Q3U0X6
RefSeq (мРНК)	NM_006526 NM_001385034	NM_001033299 NM_001159683
RefSeq (білок)	NP_006517	NP_001028471 NP_001153155
Локус (UCSC)	Хр. 20: 53.57 – 53.61 Mb	Хр. 2: 169.95 – 169.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF217 (англ. Zinc finger protein 217) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 115 272.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSKVTGNMP		TQSLLMYMDG		PEVIGSSLGS		PMEMEDALSM		KGTAVVPFRA
TQEKNVIQIE		GYMPLDCMFC		SQTFTHSEDL		NKHVLMQHRP		TLCEPAVLRV
EAEYLSPLDK		SQVRTEPPKE		KNCKENEFSC		EVCGQTFRVA		FDVEIHMRTH
KDSFTYGCNM		CGRRFKEPWF		LKNHMRTHNG		KSGARSKLQQ		GLESSPATIN
EVVQVHAAES		ISSPYKICMV		CGFLFPNKES		LIEHRKVHTK		KTAFGTSSAQ
TDSPQGGMPS		SREDFLQLFN		LRPKSHPETG		KKPVRCIPQL		DPFTTFQAWQ
LATKGKVAIC		QEVKESGQEG		STDNDDSSSE		KELGETNKGS		CAGLSQEKEK
CKHSHGEAPS		VDADPKLPSS		KEKPTHCSEC		GKAFRTYHQL		VLHSRVHKKD
RRAGAESPTM		SVDGRQPGTC		SPDLAAPLDE		NGAVDRGEGG		SEDGSEDGLP
EGIHLDKNDD		GGKIKHLTSS		RECSYCGKFF		RSNYYLNIHL		RTHTGEKPYK
CEFCEYAAAQ		KTSLRYHLER		HHKEKQTDVA		AEVKNDGKNQ		DTEDALLTAD
SAQTKNLKRF		FDGAKDVTGS		PPAKQLKEMP		SVFQNVLGSA		VLSPAHKDTQ
DFHKNAADDS		ADKVNKNPTP		AYLDLLKKRS		AVETQANNLI		CRTKADVTPP
PDGSTTHNLE		VSPKEKQTET		AADCRYRPSV		DCHEKPLNLS		VGALHNCPAI
SLSKSLIPSI		TCPFCTFKTF		YPEVLMMHQR		LEHKYNPDVH		KNCRNKSLLR
SRRTGCPPAL		LGKDVPPLSS		FCKPKPKSAF		PAQSKSLPSA		KGKQSPPGPG
KAPLTSGIDS		STLAPSNLKS		HRPQQNVGVQ		GAATRQQQSE		MFPKTSVSPA
PDKTKRPETK		LKPLPVAPSQ		PTLGSSNING		SIDYPAKNDS		PWAPPGRDYF
CNRSASNTAA		EFGEPLPKRL		KSSVVALDVD		QPGANYRRGY		DLPKYHMVRG
ITSLLPQDCV		YPSQALPPKP		RFLSSSEVDS		PNVLTVQKPY		GGSGPLYTCV
PAGSPASSST		LEGKRPVSYQ		HLSNSMAQKR		NYENFIGNAH		YRPNDKKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200

Див. також

• Хромосома 20