ZNF593

ZNF593
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZR9
Ідентифікатори
Символи	ZNF593, ZT86, zinc finger protein 593
Зовнішні ІД	OMIM: 616698 MGI: 1915290 HomoloGene: 41070 GeneCards: ZNF593
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • acyl binding • acyl carrier activity • phosphopantetheine binding • ribosomal large subunit binding • zinc ion binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • preribosome, large subunit precursor Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • ribosomal large subunit export from nucleus • lipid A biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • fatty acid biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51042	68040
Ensembl	ENSG00000142684	ENSMUSG00000028840
UniProt	O00488	Q9DB42
RefSeq (мРНК)	NM_015871	NM_024215
RefSeq (білок)	NP_056955	NP_077177
Локус (UCSC)	Хр. 1: 26.17 – 26.17 Mb	Хр. 4: 133.97 – 133.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF593 (англ. Zinc finger protein 593) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 134 амінокислот, а молекулярна маса — 15 199.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRSRRTGAH		RAHSLARQMK		AKRRRPDLDE		IHRELRPQGS		ARPQPDPNAE
FDPDLPGGGL		HRCLACARYF		IDSTNLKTHF		RSKDHKKRLK		QLSVEPYSQE
EAERAAGMGS		YVPPRRLAVP		TEVSTEVPEM		DTST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Terunuma A., Shiba K., Noda T. (1997). A novel genetic system to isolate a dominant negative effector on DNA-binding activity of Oct-2. Nucleic Acids Res. 25: 1984—1990. PMID 9115366 DOI:10.1093/nar/25.10.1984
• Hayes P.L., Lytle B.L., Volkman B.F., Peterson F.C. (2008). The solution structure of ZNF593 from Homo sapiens reveals a zinc finger in a predominantly unstructured protein. Protein Sci. 17: 571—576. PMID 18287285 DOI:10.1110/ps.073290408

Див. також

• Хромосома 1