SOX11

SOX11
Ідентифікатори
Символи	SOX11, MRD27, SRY-box 11, CSS9, SRY-box transcription factor 11
Зовнішні ІД	OMIM: 600898 MGI: 98359 HomoloGene: 37733 GeneCards: SOX11
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 27
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • translation factor activity, RNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • noradrenergic neuron differentiation • positive regulation of lens epithelial cell proliferation • диференціація клітин • cardiac ventricle formation • glial cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • limb bud formation • lung morphogenesis • sympathetic nervous system development • neural crest cell development • розвиток нирки • negative regulation of glial cell proliferation • soft palate development • ventricular septum morphogenesis • cornea development in camera-type eye • outflow tract morphogenesis • positive regulation of ossification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell death • transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • negative regulation of gene expression • negative regulation of lymphocyte proliferation • somite development • transcription, DNA-templated • neuroepithelial cell differentiation • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of hippo signaling • positive regulation of neurogenesis • multicellular organism development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • hard palate development • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • spinal cord development • positive regulation of BMP signaling pathway • glial cell proliferation • skeletal muscle cell differentiation • embryonic digestive tract morphogenesis • oligodendrocyte development • проліферація • positive regulation of stem cell proliferation • neural tube formation • positive regulation of hormone secretion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • closure of optic fissure • Біосинтез білків Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6664	20666
Ensembl	ENSG00000176887	ENSMUSG00000063632
UniProt	P35716	Q7M6Y2
RefSeq (мРНК)	NM_003108	NM_009234
RefSeq (білок)	NP_003099	NP_033260
Локус (UCSC)	Хр. 2: 5.69 – 5.7 Mb	Хр. 12: 27.38 – 27.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX11 (англ. SRY-box 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 46 679.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVQQAESLEA		ESNLPREALD		TEEGEFMACS		PVALDESDPD		WCKTASGHIK
RPMNAFMVWS		KIERRKIMEQ		SPDMHNAEIS		KRLGKRWKML		KDSEKIPFIR
EAERLRLKHM		ADYPDYKYRP		RKKPKMDPSA		KPSASQSPEK		SAAGGGGGSA
GGGAGGAKTS		KGSSKKCGKL		KAPAAAGAKA		GAGKAAQSGD		YGGAGDDYVL
GSLRVSGSGG		GGAGKTVKCV		FLDEDDDDDD		DDDELQLQIK		QEPDEEDEEP
PHQQLLQPPG		QQPSQLLRRY		NVAKVPASPT		LSSSAESPEG		ASLYDEVRAG
ATSGAGGGSR		LYYSFKNITK		QHPPPLAQPA		LSPASSRSVS		TSSSSSSGSS
SGSSGEDADD		LMFDLSLNFS		QSAHSASEQQ		LGGGAAAGNL		SLSLVDKDLD
SFSEGSLGSH		FEFPDYCTPE		LSEMIAGDWL		EANFSDLVFT		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Goze C., Poulat F., Berta P. (1993). Partial cloning of SOX-11 and SOX-12, two new human SOX genes. Nucleic Acids Res. 21: 2943—2943. PMID 8332506 DOI:10.1093/nar/21.12.2943

Див. також

• Хромосома 2