SOX30

SOX30
Ідентифікатори
Символи	SOX30, SRY-box 30, SRY-box transcription factor 30
Зовнішні ІД	OMIM: 606698 MGI: 1341157 HomoloGene: 34027 GeneCards: SOX30
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • response to corticosteroid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11063	214105
Ensembl	ENSG00000039600	ENSMUSG00000040489
UniProt	O94993	Q8CGW4
RefSeq (мРНК)	NM_001308165 NM_007017 NM_178424	NM_173384
RefSeq (білок)	NP_001295094 NP_008948 NP_848511	NP_775560
Локус (UCSC)	Хр. 5: 157.63 – 157.67 Mb	Хр. 11: 45.87 – 45.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX30 (англ. SRY-box 30) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 81 854.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERARPEPPP		QPRPLRPAPP		PLPVEGTSFW		AAAMEPPPSS		PTLSAAASAT
LASSCGEAVA		SGLQPAVRRL		LQVKPEQVLL		LPQPQAQNEE		AAASSAQARL
LQFRPDLRLL		QPPTASDGAT		SRPELHPVQP		LALHVKAKKQ		KLGPSLDQSV
GPRGAVETGP		RASRVVKLEG		PGPALGYFRG		DEKGKLEAEE		VMRDSMQGGA
GKSPAAIREG		VIKTEEPERL		LEDCRLGAEP		ASNGLVHGSA		EVILAPTSGA
FGPHQQDLRI		PLTLHTVPPG		ARIQFQGAPP		SELIRLTKVP		LTPVPTKMQS
LLEPSVKIET		KDVPLTVLPS		DAGIPDTPFS		KDRNGHVKRP		MNAFMVWARI
HRPALAKANP		AANNAEISVQ		LGLEWNKLSE		EQKKPYYDEA		QKIKEKHREE
FPGWVYQPRP		GKRKRFPLSV		SNVFSGTTQN		IISTNPTTVY		PYRSPTYSVV
IPSLQNPITH		PVGETSPAIQ		LPTPAVQSPS		PVTLFQPSVS		SAAQVAVQDP
SLPVYPALPP		QRFTGPSQTD		THQLHSEATH		TVKQPTPVSL		ESANRISSSA
STAHARFATS		TIQPPREYSS		VSPCPRSAPI		PQASPIPHPH		VYQPPPLGHP
ATLFGTPPRF		SFHHPYFLPG		PHYFPSSTCP		YSRPPFGYGN		FPSSMPECLS
YYEDRYPKHE		GIFSTLNRDY		SFRDYSSECT		HSENSRSCEN		MNGTSYYNSH
SHSGEENLNP		VPQLDIGTLE		NVFTAPTSTP		SSIQQVNVTD		SDEEEEEKVL
RDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5