HOXB13

HOXB13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CRA
Ідентифікатори
Символи	HOXB13, PSGD, homeobox B13, HPC9
Зовнішні ІД	OMIM: 604607 MGI: 107730 HomoloGene: 4640 GeneCards: HOXB13
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methyl-CpG binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма Біологічний процес • response to testosterone • morphogenesis of an epithelium • multicellular organism development • regulation of growth • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to wounding • prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis • Ангіогенез • transcription, DNA-templated • epithelial cell maturation involved in prostate gland development • epidermis development • prostate gland development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10481	15408
Ensembl	ENSG00000159184	ENSMUSG00000049604
UniProt	Q92826	P70321
RefSeq (мРНК)	NM_006361	NM_008267
RefSeq (білок)	NP_006352	NP_032293
Локус (UCSC)	Хр. 17: 48.72 – 48.73 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXB13 (англ. Homeobox B13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 30 676.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPGNYATLD		GAKDIEGLLG		AGGGRNLVAH		SPLTSHPAAP		TLMPAVNYAP
LDLPGSAEPP		KQCHPCPGVP		QGTSPAPVPY		GYFGGGYYSC		RVSRSSLKPC
AQAATLAAYP		AETPTAGEEY		PSRPTEFAFY		PGYPGTYQPM		ASYLDVSVVQ
TLGAPGEPRH		DSLLPVDSYQ		SWALAGGWNS		QMCCQGEQNP		PGPFWKAAFA
DSSGQHPPDA		CAFRRGRKKR		IPYSKGQLRE		LEREYAANKF		ITKDKRRKIS
AATSLSERQI		TIWFQNRRVK		EKKVLAKVKN		SATP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Breyer J.P., Avritt T.G., McReynolds K.M., Dupont W.D., Smith J.R. (2012). Confirmation of the HOXB13 G84E germline mutation in familial prostate cancer. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 21: 1348—1353. PMID 22714738 DOI:10.1158/1055-9965.EPI-12-0495
• Zeltser L.M., Desplan C., Heintz N. (1996). Hoxb-13: a new Hox gene in a distant region of the HOXB cluster maintains colinearity. Development. 122: 2475—2484. PMID 8756292

Див. також

• Хромосома 17