HIVEP1

HIVEP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BBO, 4ZNF
Ідентифікатори
Символи	HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, HIVEP zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 194540 MGI: 96100 HomoloGene: 1596 GeneCards: HIVEP1
Пов'язані генетичні захворювання
токсикоманія
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • BMP signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3096	110521
Ensembl	ENSG00000095951	ENSMUSG00000021366
UniProt	P15822	Q03172
RefSeq (мРНК)	NM_002114	NM_007772
RefSeq (білок)	NP_002105	NP_031798
Локус (UCSC)	Хр. 6: 12.01 – 12.16 Mb	Хр. 13: 42.21 – 42.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIVEP1 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 718 амінокислот, а молекулярна маса — 296 865.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRTKQIHPR		NLRDKIEEAQ		KELNGAEVSK		KEILQAGVKG		TSESLKGVKR
KKIVAENHLK		KIPKSPLRNP		LQAKHKQNTE		ESSFAVLHSA		SESHKKQNYI
PVKNGKQFTK		QNGETPGIIA		EASKSEESVS		PKKPLFLQQP		SELRRWRSEG
ADPAKFSDLD		EQCDSSSLSS		KTRTDNSECI		SSHCGTTSPS		YTNTAFDVLL
KAMEPELSTL		SQKGSPCAIK		TEKLRPNKTA		RSPPKLKNSS		MDAPNQTSQE
LVAESQSSCT		SYTVHMSAAQ		KNEQGAMQSA		SHLYHQHEHF		VPKSNQHNQQ
LPGCSGFTGS		LTNLQNQENA		KLEQVYNIAV		TSSVGLTSPS		SRSQVTPQNQ
QMDSASPLSI		SPANSTQSPP		MPIYNSTHVA		SVVNQSVEQM		CNLLLKDQKP
KKQGKYICEY		CNRACAKPSV		LLKHIRSHTG		ERPYPCVTCG		FSFKTKSNLY
KHKKSHAHTI		KLGLVLQPDA		GGLFLSHESP		KALSIHSDVE		DSGESEEEGA
TDERQHDLGA		MELQPVHIIK		RMSNAETLLK		SSFTPSSPEN		VIGDFLLQDR
SAESQAVTEL		PKVVVHHVTV		SPLRTDSPKA		MDPKPELSSA		QKQKDLQVTN
VQPLSANMSQ		GGVSRLETNE		NSHQKGDMNP		LEGKQDSHVG		TVHAQLQRQQ
ATDYSQEQQG		KLLSPRSLGS		TDSGYFSRSE		SADQTVSPPT		PFARRLPSTE
QDSGRSNGPS		AALVTTSTPS		ALPTGEKALL		LPGQMRPPLA		TKTLEERISK
LISDNEALVD		DKQLDSVKPR		RTSLSRRGSI		DSPKSYIFKD		SFQFDLKPVG
RRTSSSSDIP		KSPFTPTEKS		KQVFLLSVPS		LDCLPITRSN		SMPTTGYSAV
PANIIPPPHP		LRGSQSFDDK		IGTFYDDVFV		SGPNAPVPQS		GHPRTLVRQA
AIEDSSANES		HVLGTGQSLD		ESHQGCHAAG		EAMSVRSKAL		AQGPHIEKKK
SHQGRGTMFE		CETCRNRYRK		LENFENHKKF		YCSELHGPKT		KVAMREPEHS
PVPGGLQPQI		LHYRVAGSSG		IWEQTPQIRK		RRKMKSVGDD		EELQQNESGT
SPKSSEGLQF		QNALGCNPSL		PKHNVTIRSD		QQHKNIQLQN		SHIHLVARGP
EQTMDPKLST		IMEQQISSAA		QDKIELQRHG		TGISVIQHTN		SLSRPNSFDK
PEPFERASPV		SFQELNRTGK		SGSLKVIGIS		QEESHPSRDG		SHPHQLALSD
ALRGELQESS		RKSPSERHVL		GQPSRLVRQH		NIQVPEILVT		EEPDRDLEAQ
CHDQEKSEKF		SWPQRSETLS		KLPTEKLPPK		KKRLRLAEIE		HSSTESSFDS
TLSRSLSRES		SLSHTSSFSA		SLDIEDVSKT		EASPKIDFLN		KAEFLMIPAG
LNTLNVPGCH		REMRRTASEQ		INCTQTSMEV		SDLRSKSFDC		GSITPPQTTP
LTELQPPSSP		SRVGVTGHVP		LLERRRGPLV		RQISLNIAPD		SHLSPVHPTS
FQNTALPSVN		AVPYQGPQLT		STSLAEFSAN		TLHSQTQVKD		LQAETSNSSS
TNVFPVQQLC		DINLLNQIHA		PPSHQSTQLS		LQVSTQGSKP		DKNSVLSGSS
KSEDCFAPKY		QLHCQVFTSG		PSCSSNPVHS		LPNQVISDPV		GTDHCVTSAT
LPTKLIDSMS		NSHPLLPPEL		RPLGSQVQKV		PSSFMLPIRL		QSSVPAYCFA
TLTSLPQILV		TQDLPNQPIC		QTNHSVVPIS		EEQNSVPTLQ		KGHQNALPNP
EKEFLCENVF		SEMSQNSSLS		ESLPITQKIS		VGRLSPQQES		SASSKRMLSP
ANSLDIAMEK		HQKRAKDENG		AVCATDVRPL		EALSSRVNEA		SKQKKPILVR
QVCTTEPLDG		VMLEKDVFSQ		PEISNEAVNL		TNVLPADNSS		TGCSKFVVIE
PISELQEFEN		IKSSTSLTLT		VRSSPAPSEN		THISPLKCTD		NNQERKSPGV
KNQGDKVNIQ		EQSQQPVTSL		SLFNIKDTQQ		LAFPSLKTTT		NFTWCYLLRQ
KSLHLPQKDQ		KTSAYTDWTV		SASNPNPLGL		PTKVALALLN		SKQNTGKSLY
CQAITTHSKS		DLLVYSSKWK		SSLSKRALGN		QKSTVVEFSN		KDASEINSEQ
DKENSLIKSE		PRRIKIFDGG		YKSNEEYVYV		RGRGRGKYIC		EECGIRCKKP
SMLKKHIRTH		TDVRPYHCTY		CNFSFKTKGN		LTKHMKSKAH		SKKCVDLGVS
VGLIDEQDTE		ESDEKQRFSY		ERSGYDLEES		DGPDEDDNEN		EDDDEDSQAE
SVLSATPSVT		ASPQHLPSRS		SLQDPVSTDE		DVRITDCFSG		VHTDPMDVLP
RALLTRMTVL		STAQSDYNRK		TLSPGKARQR		AARDENDTIP		SVDTSRSPCH
QMSVDYPESE		EILRSSMAGK		AVAITQSPSS		VRLPPAAAEH		SPQTAAGMPS
VASPHPDPQE		QKQQITLQPT		PGLPSPHTHL		FSHLPLHSQQ		QSRTPYNMVP
VGGIHVVPAG		LTYSTFVPLQ		AGPVQLTIPA		VSVVHRTLGT		HRNTVTEVSG
TTNPAGVAEL		SSVVPCIPIG		QIRVPGLQNL		STPGLQSLPS		LSMETVNIVG
LANTNMAPQV		HPPGLALNAV		GLQVLTANPS		SQSSPAPQAH		IPGLQILNIA
LPTLIPSVSQ		VAVDAQGAPE		MPASQSKACE		TQPKQTSVAS		ANQVSRTESP
QGLPTVQREN		AKKVLNPPAP		AGDHARLDGL		SKMDTEKAAS		ANHVKPKPEL
TSIQGQPAST		SQPLLKAHSE		VFTKPSGQQT		LSPDRQVPRP		TALPRRQPTV
HFSDVSSDDD		EDRLVIAT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Fan C.M., Maniatis T. (1990). A DNA-binding protein containing two widely separated zinc finger motifs that recognize the same DNA sequence. Genes Dev. 4: 29—42. PMID 2106471 DOI:10.1101/gad.4.1.29
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Baldwin A.S. Jr., LeClair K.P., Singh H., Sharp P.A. (1990). A large protein containing zinc finger domains binds to related sequence elements in the enhancers of the class I major histocompatibility complex and kappa immunoglobulin genes. Mol. Cell. Biol. 10: 1406—1414. PMID 2108316 DOI:10.1128/MCB.10.4.1406
• Lallemand C., Palmieri M., Blanchard B., Meritet J.F., Tovey M.G. (2002). GAAP-1: a transcriptional activator of p53 and IRF-1 possesses pro-apoptotic activity. EMBO Rep. 3: 153—158. PMID 11818340 DOI:10.1093/embo-reports/kvf032
• Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
• Omichinski J.G., Clore G.M., Appella E., Sakaguchi K., Gronenborn A.M. (1990). High-resolution three-dimensional structure of a single zinc finger from a human enhancer binding protein in solution. Biochemistry. 29: 9324—9334. PMID 2248949 DOI:10.1021/bi00492a004

Див. також

• Хромосома 6