IRX5

IRX5
Ідентифікатори
Символи	IRX5, HMMS, IRX-2a, IRXB2, iroquois homeobox 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606195 GeneCards: IRX5
Пов'язані генетичні захворювання
	craniofacial dysplasia-osteopenia syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • vitamin D binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• retinal bipolar neuron differentiation; • регуляція експресії генів; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • gonad development; • розвиток клітин; • transcription, DNA-templated; • регуляція серцевого ритму; • зір; • neuron maturation; • відповідь на стимул; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10265
	н/д
	ENSG00000176842
	н/д
	P78411
	н/д
	NM_001252197; NM_005853
	н/д
	NP_001239126; NP_005844
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

IRX5 (англ. Iroquois homeobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 50 361^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYPQGYLYQ	PSASLALYSC	PAYSTSVISG	PRTDELGRSS	SGSAFSPYAG
STAFTAPSPG	YNSHLQYGAD	PAAAAAAAFS	SYVGSPYDHT	PGMAGSLGYH
PYAAPLGSYP	YGDPAYRKNA	TRDATATLKA	WLNEHRKNPY	PTKGEKIMLA
IITKMTLTQV	STWFANARRR	LKKENKMTWT	PRNRSEDEEE	EENIDLEKND
EDEPQKPEDK	GDPEGPEAGG	AEQKAASGCE	RLQGPPTPAG	KETEGSLSDS
DFKEPPSEGR	LDALQGPPRT	GGPSPAGPAA	ARLAEDPAPH	YPAGAPAPGP
HPAAGEVPPG	PGGPSVIHSP	PPPPPPAVLA	KPKLWSLAEI	ATSSDKVKDG
GGGNEGSPCP	PCPGPIAGQA	LGGSRASPAP	APSRSPSAQC	PFPGGTVLSR
PLYYTAPFYP	GYTNYGSFGH	LHGHPGPGPG	PTTGPGSHFN	GLNQTVLNRA
DALAKDPKML	RSQSQLDLCK	DSPYELKKGM	SDI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, вітаміном D. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Lewis M.T., Ross S., Strickland P.A., Snyder C.J., Daniel C.W. (1999). Regulated expression patterns of IRX-2, an Iroquois-class homeobox gene, in the human breast. Cell Tissue Res. 296: 549—554. PMID 10370142 DOI:10.1007/s004410051316