Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBX19
Ідентифікатори
Символи
TBX19 , TBS19, TPIT, dJ747L4.1, T-box 19, T-box transcription factor 19
Зовнішні ІД
OMIM : 604614 MGI: 1891158 HomoloGene: 3779 GeneCards: TBX19
Пов'язані генетичні захворювання
adrenocorticotropic hormone deficiency [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • pituitary gland development • regulation of cell population proliferation • cell fate commitment • регуляція диференціювання клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 168.28 – 168.31 Mb
Хр. 1: 164.97 – 164.99 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
TBX19 (англ. T-box 19 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 448 амінокислот , а молекулярна маса — 48 238[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMSELGTRK PSDGTVSHLL NVVESELQAG REKGDPTEKQ LQIILEDAPL
WQRFKEVTNE MIVTKNGRRM FPVLKISVTG LDPNAMYSLL LDFVPTDSHR
WKYVNGEWVP AGKPEVSSHS CVYIHPDSPN FGAHWMKAPI SFSKVKLTNK
LNGGGQIMLN SLHKYEPQVH IVRVGSAHRM VTNCSFPETQ FIAVTAYQNE
EITALKIKYN PFAKAFLDAK ERNHLRDVPE AISESQHVTY SHLGGWIFSN
PDGVCTAGNS NYQYAAPLPL PAPHTHHGCE HYSGLRGHRQ APYPSAYMHR
NHSPSVNLIE SSSNNLQVFS GPDSWTSLSS TPHASILSVP HTNGPINPGP
SPYPCLWTIS NGAGGPSGPG PEVHASTPGA FLLGNPAVTS PPSVLSTQAP
TSAGVEVLGE PSLTSIAVST WTAVASHPFA GWGGPGAGGH HSPSSLDG
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші