USF1

USF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AN4
Ідентифікатори
Символи	USF1, FCHL, FCHL1, HYPLIP1, MLTF, MLTFI, UEF, bHLHb11, upstream transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191523 MGI: 99542 HomoloGene: 31426 GeneCards: USF1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • histone deacetylase binding • bHLH transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • double-stranded DNA binding • protein kinase binding • protein homodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • sequence-specific DNA binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро • NURF complex • Set1C/COMPASS complex • Нуклеоплазма Біологічний процес • carbon catabolite regulation of transcription • negative regulation of fibrinolysis • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucose homeostasis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • late viral transcription • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • glucose metabolic process • cellular response to insulin stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • lipid homeostasis • response to UV Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7391	22278
Ensembl	ENSG00000158773	ENSMUSG00000026641
UniProt	P22415	Q61069
RefSeq (мРНК)	NM_207005 NM_001276373 NM_007122	NM_009480 NM_001305676 NM_001305677 NM_001305678
RefSeq (білок)	NP_001263302 NP_009053 NP_996888	NP_001292605 NP_001292606 NP_001292607 NP_033506
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161.04 – 161.05 Mb	Хр. 1: 171.24 – 171.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USF1 (англ. Upstream transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 538.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKGQQKTAET		EEGTVQIQEG		AVATGEDPTS		VAIASIQSAA		TFPDPNVKYV
FRTENGGQVM		YRVIQVSEGQ		LDGQTEGTGA		ISGYPATQSM		TQAVIQGAFT
SDDAVDTEGT		AAETHYTYFP		STAVGDGAGG		TTSGSTAAVV		TTQGSEALLG
QATPPGTGQF		FVMMSPQEVL		QGGSQRSIAP		RTHPYSPKSE		APRTTRDEKR
RAQHNEVERR		RRDKINNWIV		QLSKIIPDCS		MESTKSGQSK		GGILSKACDY
IQELRQSNHR		LSEELQGLDQ		LQLDNDVLRQ		QVEDLKNKNL		LLRAQLRHHG
LEVVIKNDSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Gregor P.D., Sawadogo M., Roeder R.G. (1990). The adenovirus major late transcription factor USF is a member of the helix-loop-helix group of regulatory proteins and binds to DNA as a dimer. Genes Dev. 4: 1730—1740. PMID 2249772 DOI:10.1101/gad.4.10.1730
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rahaus M., Desloges N., Yang M., Ruyechan W.T., Wolff M.H. (2003). Transcription factor USF, expressed during the entire phase of Varicella-zoster virus infection, interacts physically with the major viral transactivator IE62 and plays a significant role in virus replication. J. Gen. Virol. 84: 2957—2967. PMID 14573800 DOI:10.1099/vir.0.19335-0
• Ferre-D'Amare A.R., Pognonec P., Roeder R.G., Burley S.K. (1994). Structure and function of the b/HLH/Z domain of USF. EMBO J. 13: 180—189. PMID 8306960

Див. також

• Хромосома 1