IRF4

IRF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DLL
Ідентифікатори
Символи	IRF4, LSIRF, MUM1, NF-EM5, SHEP8, interferon regulatory factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: IRF4
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз, skin carcinoma, progressive supranuclear palsy
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein-lysine N-methyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of T-helper cell differentiation • myeloid dendritic cell differentiation • transcription, DNA-templated • T-helper 17 cell lineage commitment • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • peptidyl-lysine methylation • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • type I interferon signaling pathway • histone H3 acetylation • histone H4 acetylation • positive regulation of DNA binding • T cell activation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • defense response to protozoan • Метилювання білків • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • процес імунної системи Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3662	16364
Ensembl	ENSG00000137265	ENSMUSG00000021356
UniProt	Q15306	Q64287
RefSeq (мРНК)	NM_001195286 NM_002460	NM_013674 NM_001347508
RefSeq (білок)	NP_001182215 NP_002451	NP_001334437 NP_038702
Локус (UCSC)	Хр. 6: 0.39 – 0.41 Mb	Хр. 13: 30.93 – 30.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF4 (англ. Interferon regulatory factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 51 772.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLEGGGRGG		EFGMSAVSCG		NGKLRQWLID		QIDSGKYPGL		VWENEEKSIF
RIPWKHAGKQ		DYNREEDAAL		FKAWALFKGK		FREGIDKPDP		PTWKTRLRCA
LNKSNDFEEL		VERSQLDISD		PYKVYRIVPE		GAKKGAKQLT		LEDPQMSMSH
PYTMTTPYPS		LPAQQVHNYM		MPPLDRSWRD		YVPDQPHPEI		PYQCPMTFGP
RGHHWQGPAC		ENGCQVTGTF		YACAPPESQA		PGVPTEPSIR		SAEALAFSDC
RLHICLYYRE		ILVKELTTSS		PEGCRISHGH		TYDASNLDQV		LFPYPEDNGQ
RKNIEKLLSH		LERGVVLWMA		PDGLYAKRLC		QSRIYWDGPL		ALCNDRPNKL
ERDQTCKLFD		TQQFLSELQA		FAHHGRSLPR		FQVTLCFGEE		FPDPQRQRKL
ITAHVEPLLA		RQLYYFAQQN		SGHFLRGYDL		PEHISNPEDY		HRSIRHSSIQ
E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 DOI:10.1074/jbc.274.16.11115

Див. також

• Хромосома 6