Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
POU4F3
Ідентифікатори
Символи
POU4F3 , BRN3C, DFNA15, POU class 4 homeobox 3, DFNA42, DFNA52
Зовнішні ІД
OMIM : 602460 MGI: 102523 HomoloGene: 2023 GeneCards: POU4F3
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant nonsyndromic deafness 15 , nonsyndromic deafness [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • sensory perception of sound • inner ear development • зір • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • vestibulocochlear nerve development • retinal ganglion cell axon guidance • inner ear morphogenesis • inner ear auditory receptor cell differentiation • axon extension • neuromuscular process controlling balance • neuron apoptotic process • inner ear receptor cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 146.34 – 146.34 Mb
Хр. 18: 42.53 – 42.53 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
POU4F3 (англ. POU class 4 homeobox 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот , а молекулярна маса — 37 052[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMAMNSKQPF GMHPVLQEPK FSSLHSGSEA MRRVCLPAPQ LQGNIFGSFD
ESLLARAEAL AAVDIVSHGK NHPFKPDATY HTMSSVPCTS TSSTVPISHP
AALTSHPHHA VHQGLEGDLL EHISPTLSVS GLGAPEHSVM PAQIHPHHLG
AMGHLHQAMG MSHPHTVAPH SAMPACLSDV ESDPRELEAF AERFKQRRIK
LGVTQADVGA ALANLKIPGV GSLSQSTICR FESLTLSHNN MIALKPVLQA
WLEEAEAAYR EKNSKPELFN GSERKRKRTS IAAPEKRSLE AYFAIQPRPS
SEKIAAIAEK LDLKKNVVRV WFCNQRQKQK RMKYSAVH
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші