THRA

THRA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NAV, 2H77, 2H79, 3HZF, 3ILZ, 3JZB, 4LNW, 4LNX
Ідентифікатори
Символи	THRA, AR7, CHNG6, EAR7, ERB-T-1, ERBA, ERBA1, NR1A1, THRA1, THRA2, c-ERBA-1, thyroid hormone receptor, alpha, thyroid hormone receptor alpha, TRalpha
Зовнішні ІД	OMIM: 190120 MGI: 98742 HomoloGene: 37747 GeneCards: THRA
Пов'язані генетичні захворювання
congenital nongoitrous hypothryoidism 6
Реагує на сполуку
DL-3,3',5'-triiodothyronine, tiratricol, трийодтиронін, левотироксин
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • zinc ion binding • chromatin DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • steroid receptor RNA activator RNA binding • transcription factor binding • TBP-class protein binding • steroid hormone receptor activity • DNA binding • protein domain specific binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • thyroid hormone binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to cold • cytoplasmic sequestering of transcription factor • hormone-mediated signaling pathway • regulation of thyroid hormone mediated signaling pathway • thyroid gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • осифікація • female courtship behavior • cartilage condensation • negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • type I pneumocyte differentiation • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid catabolic process • regulation of heart contraction • animal organ morphogenesis • positive regulation of female receptivity • learning or memory • regulation of myeloid cell apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • erythrocyte differentiation • negative regulation of DNA-templated transcription, initiation • positive regulation of myotube differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • thyroid hormone mediated signaling pathway • multicellular organism development • brain development • диференціація клітин • response to lipid • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7067	21833
Ensembl	ENSG00000126351	ENSMUSG00000058756
UniProt	P10827	P63058
RefSeq (мРНК)	NM_199334 NM_001190918 NM_001190919 NM_003250	NM_178060 NM_001313983
RefSeq (білок)	NP_001177847 NP_001177848 NP_003241 NP_955366	NP_001300912 NP_835161
Локус (UCSC)	Хр. 17: 40.06 – 40.09 Mb	Хр. 11: 98.63 – 98.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THRA (англ. Thyroid hormone receptor, alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 54 816.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQKPSKVEC		GSDPEENSAR		SPDGKRKRKN		GQCSLKTSMS		GYIPSYLDKD
EQCVVCGDKA		TGYHYRCITC		EGCKGFFRRT		IQKNLHPTYS		CKYDSCCVID
KITRNQCQLC		RFKKCIAVGM		AMDLVLDDSK		RVAKRKLIEQ		NRERRRKEEM
IRSLQQRPEP		TPEEWDLIHI		ATEAHRSTNA		QGSHWKQRRK		FLPDDIGQSP
IVSMPDGDKV		DLEAFSEFTK		IITPAITRVV		DFAKKLPMFS		ELPCEDQIIL
LKGCCMEIMS		LRAAVRYDPE		SDTLTLSGEM		AVKREQLKNG		GLGVVSDAIF
ELGKSLSAFN		LDDTEVALLQ		AVLLMSTDRS		GLLCVDKIEK		SQEAYLLAFE
HYVNHRKHNI		PHFWPKLLMK		EREVQSSILY		KGAAAEGRPG		GSLGVHPEGQ
QLLGMHVVQG		PQVRQLEQQL		GEAGSLQGPV		LQHQSPKSPQ		QRLLELLHRS
GILHARAVCG		EDDSSEADSP		SSSEEEPEVC		EDLAGNAASP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Pfahl M., Benbrook D. (1987). Nucleotide sequence of cDNA encoding a novel human thyroid hormone receptor. Nucleic Acids Res. 15: 9613—9613. PMID 3684612 DOI:10.1093/nar/15.22.9613
• Nakai A., Sakurai A., Bell G.I., Degroot L.J. (1988). Characterization of a third human thyroid hormone receptor coexpressed with other thyroid hormone receptors in several tissues. Mol. Endocrinol. 2: 1087—1092. PMID 2464749 DOI:10.1210/mend-2-11-1087
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Benbrook D., Pfahl M. (1987). A novel thyroid hormone receptor encoded by a cDNA clone from a human testis library. Science. 238: 788—791. PMID 3672126 DOI:10.1126/science.3672126
• Yang Y.Z., Burgos-Trinidad M., Wu Y., Koenig R.J. (1996). Thyroid hormone receptor variant alpha2. Role of the ninth heptad in dna binding, heterodimerization with retinoid X receptors, and dominant negative activity. J. Biol. Chem. 271: 28235—28242. PMID 8910441 DOI:10.1074/jbc.271.45.28235

Див. також

• Хромосома 17