Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
EGR3
Ідентифікатори
Символи
EGR3 , EGR-3, PILOT, early growth response 3
Зовнішні ІД
OMIM : 602419 MGI: 1306780 HomoloGene: 37923 GeneCards: EGR3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• циркадний ритм • endothelial cell chemotaxis • cell migration involved in sprouting angiogenesis • muscle organ development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell proliferation • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • negative regulation of apoptotic process • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • transcription, DNA-templated • neuromuscular synaptic transmission • peripheral nervous system development • positive regulation of T cell differentiation in thymus • regulation of gamma-delta T cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to growth factor stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 8: 22.69 – 22.69 Mb
Хр. 14: 70.31 – 70.32 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
EGR3 (англ. Early growth response 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот , а молекулярна маса — 42 613[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTGKLAEKLP VTMSSLLNQL PDNLYPEEIP SALNLFSGSS DSVVHYNQMA
TENVMDIGLT NEKPNPELSY SGSFQPAPGN KTVTYLGKFA FDSPSNWCQD
NIISLMSAGI LGVPPASGAL STQTSTASMV QPPQGDVEAM YPALPPYSNC
GDLYSEPVSF HDPQGNPGLA YSPQDYQSAK PALDSNLFPM IPDYNLYHHP
NDMGSIPEHK PFQGMDPIRV NPPPITPLET IKAFKDKQIH PGFGSLPQPP
LTLKPIRPRK YPNRPSKTPL HERPHACPAE GCDRRFSRSD ELTRHLRIHT
GHKPFQCRIC MRSFSRSDHL TTHIRTHTGE KPFACEFCGR KFARSDERKR
HAKIHLKQKE KKAEKGGAPS ASSAPPVSLA PVVTTCA
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Mages H.W., Stamminger T., Rilke O., Bravo R., Kroczek R.A. (1993). Expression of PILOT, a putative transcription factor, requires two signals and is cyclosporin A sensitive in T cells. Int. Immunol . 5 : 63—70. PMID 8443122 DOI :10.1093/intimm/5.1.63
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші