Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PHF20 (англ. PHD finger protein 20 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 012 амінокислот , а молекулярна маса — 115 386[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTKHPPNRRG ISFEVGAQLE ARDRLKNWYP AHIEDIDYEE GKVLIHFKRW
NHRYDEWFCW DSPYLRPLEK IQLRKEGLHE EDGSSEFQIN EQVLACWSDC
RFYPAKVTAV NKDGTYTVKF YDGVVQTVKH IHVKAFSKDQ NIVGNARPKE
TDHKSLSSSP DKREKFKEQR KATVNVKKDK EDKPLKTEKR PKQPDKEGKL
ICSEKGKVSE KSLPKNEKED KENISENDRE YSGDAQVDKK PENDIVKSPQ
ENLREPKRKR GRPPSIAPTA VDSNSQTLQP ITLELRRRKI SKGCEVPLKR
PRLDKNSSQE KSKNYSENTD KDLSRRRSSR LSTNGTHEIL DPDLVVSDLV
DTDPLQDTLS STKESEEGQL KSALEAGQVS SALTCHSFGD GSGAAGLELN
CPSMGENTMK TEPTSPLVEL QEISTVEVTN TFKKTDDFGS SNAPAVDLDH
KFRCKVVDCL KFFRKAKLLH YHMKYFHGME KSLEPEESPG KRHVQTRGPS
ASDKPSQETL TRKRVSASSP TTKDKEKNKE KKFKEFVRVK PKKKKKKKKK
TKPECPCSEE ISDTSQEPSP PKAFAVTRCG SSHKPGVHMS PQLHGPESGH
HKGKVKALEE DNLSESSSES FLWSDDEYGQ DVDVTTNPDE ELDGDDRYDF
EVVRCICEVQ EENDFMIQCE ECQCWQHGVC MGLLEENVPE KYTCYVCQDP
PGQRPGFKYW YDKEWLSRGH MHGLAFLEEN YSHQNAKKIV ATHQLLGDVQ
RVIEVLHGLQ LKMSILQSRE HPDLPLWCQP WKQHSGEGRS HFRNIPVTDT
RSKEEAPSYR TLNGAVEKPR PLALPLPRSV EESYITSEHC YQKPRAYYPA
VEQKLVVETR GSALDDAVNP LHENGDDSLS PRLGWPLDQD RSKGDSDPKP
GSPKVKEYVS KKALPEEAPA RKLLDRGGEG LLSSQHQWQF NLLTHVESLQ
DEVTHRMDSI EKELDVLESW LDYTGELEPP EPLARLPQLK HCIKQLLMDL
GKVQQIALCC ST
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші