PHF20

PHF20
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P8D, 3Q1J, 3QII, 3SD4
Ідентифікатори
Символи	PHF20, C20orf104, GLEA2, HCA58, NZF, TDRD20A, TZP, PHD finger protein 20
Зовнішні ІД	OMIM: 610335 MGI: 2444148 HomoloGene: 9507 GeneCards: PHF20
Онтологія гена Молекулярна функція • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific) • DNA binding • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific) • зв'язування з іоном металу • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific) • GO:0001948 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • Ядерна мембрана • histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • nucleoplasm • гіалоплазма • MLL1 complex Біологічний процес • histone H4-K16 acetylation • regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H4-K5 acetylation • histone H4-K8 acetylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • chromatin organization • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51230	228829
Ensembl	ENSG00000025293	ENSMUSG00000038116
UniProt	Q9BVI0 Q5JWZ0	Q8BLG0
RefSeq (мРНК)	NM_016436	NM_172674
RefSeq (білок)	NP_057520	NP_766262
Локус (UCSC)	Хр. 20: 35.77 – 35.95 Mb	Хр. 2: 156.2 – 156.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHF20 (англ. PHD finger protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 012 амінокислот, а молекулярна маса — 115 386.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKHPPNRRG		ISFEVGAQLE		ARDRLKNWYP		AHIEDIDYEE		GKVLIHFKRW
NHRYDEWFCW		DSPYLRPLEK		IQLRKEGLHE		EDGSSEFQIN		EQVLACWSDC
RFYPAKVTAV		NKDGTYTVKF		YDGVVQTVKH		IHVKAFSKDQ		NIVGNARPKE
TDHKSLSSSP		DKREKFKEQR		KATVNVKKDK		EDKPLKTEKR		PKQPDKEGKL
ICSEKGKVSE		KSLPKNEKED		KENISENDRE		YSGDAQVDKK		PENDIVKSPQ
ENLREPKRKR		GRPPSIAPTA		VDSNSQTLQP		ITLELRRRKI		SKGCEVPLKR
PRLDKNSSQE		KSKNYSENTD		KDLSRRRSSR		LSTNGTHEIL		DPDLVVSDLV
DTDPLQDTLS		STKESEEGQL		KSALEAGQVS		SALTCHSFGD		GSGAAGLELN
CPSMGENTMK		TEPTSPLVEL		QEISTVEVTN		TFKKTDDFGS		SNAPAVDLDH
KFRCKVVDCL		KFFRKAKLLH		YHMKYFHGME		KSLEPEESPG		KRHVQTRGPS
ASDKPSQETL		TRKRVSASSP		TTKDKEKNKE		KKFKEFVRVK		PKKKKKKKKK
TKPECPCSEE		ISDTSQEPSP		PKAFAVTRCG		SSHKPGVHMS		PQLHGPESGH
HKGKVKALEE		DNLSESSSES		FLWSDDEYGQ		DVDVTTNPDE		ELDGDDRYDF
EVVRCICEVQ		EENDFMIQCE		ECQCWQHGVC		MGLLEENVPE		KYTCYVCQDP
PGQRPGFKYW		YDKEWLSRGH		MHGLAFLEEN		YSHQNAKKIV		ATHQLLGDVQ
RVIEVLHGLQ		LKMSILQSRE		HPDLPLWCQP		WKQHSGEGRS		HFRNIPVTDT
RSKEEAPSYR		TLNGAVEKPR		PLALPLPRSV		EESYITSEHC		YQKPRAYYPA
VEQKLVVETR		GSALDDAVNP		LHENGDDSLS		PRLGWPLDQD		RSKGDSDPKP
GSPKVKEYVS		KKALPEEAPA		RKLLDRGGEG		LLSSQHQWQF		NLLTHVESLQ
DEVTHRMDSI		EKELDVLESW		LDYTGELEPP		EPLARLPQLK		HCIKQLLMDL
GKVQQIALCC		ST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20