HBP1

HBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E6O, 3QVE
Ідентифікатори
Символи	HBP1, HMG-box transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 616714 MGI: 894659 HomoloGene: 8171 GeneCards: HBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26959	73389
Ensembl	ENSG00000105856 ENSG00000283847	ENSMUSG00000002996
UniProt	O60381	Q8R316
RefSeq (мРНК)	NM_001244262 NM_012257	NM_153198 NM_177993 NM_001361928
RefSeq (білок)	NP_001231191 NP_036389	NP_694878 NP_818774 NP_001348857
Локус (UCSC)	Хр. 7: 107.17 – 107.2 Mb	Хр. 12: 31.98 – 32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HBP1 (англ. HMG-box transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 514 амінокислот, а молекулярна маса — 57 645.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVWEVKTNQM		PNAVQKLLLV		MDKRASGMND		SLELLQCNEN		LPSSPGYNSC
DEHMELDDLP		ELQAVQSDPT		QSGMYQLSSD		VSHQEYPRSS		WNQNTSDIPE
TTYRENEVDW		LTELANIATS		PQSPLMQCSF		YNRSSPVHII		ATSKSLHSYA
RPPPVSSSSK		SEPAFPHHHW		KEETPVRHER		ANSESESGIF		CMSSLSDDDD
LGWCNSWPST		VWHCFLKGTR		LCFHKGSNKE		WQDVEDFARA		EGCDNEEDLQ
MGIHKGYGSD		GLKLLSHEES		VSFGESVLKL		TFDPGTVEDG		LLTVECKLDH
PFYVKNKGWS		SFYPSLTVVQ		HGIPCCEVHI		GDVCLPPGHP		DAINFDDSGV
FDTFKSYDFT		PMDSSAVYVL		SSMARQRRAS		LSCGGPGGQD		FARSGFSKNC
GSPGSSQLSS		NSLYAKAVKN		HSSGTVSATS		PNKCKRPMNA		FMLFAKKYRV
EYTQMYPGKD		NRAISVILGD		RWKKMKNEER		RMYTLEAKAL		AEEQKRLNPD
CWKRKRTNSG		SQQH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7