Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
E2F1
Ідентифікатори
Символи
E2F1 , E2F-1, RBAP1, RBBP3, RBP3, E2F transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 189971 MGI: 101941 HomoloGene: 3828 GeneCards: E2F1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001948 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein kinase binding • GO:0001158 core promoter proximal region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Цитоплазма • transcription regulator complex • Rb-E2F complex • nuclear chromatin • клітинне ядро • мітохондрія • nucleoplasm • центросома • macromolecular complex • RNA polymerase II transcription factor complex
Біологічний процес
• cellular response to nerve growth factor stimulus • negative regulation of fat cell differentiation • regulation of transcription, DNA-templated • lens fiber cell apoptotic process • negative regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of DNA binding • negative regulation of fat cell proliferation • DNA damage checkpoint • cellular response to xenobiotic stimulus • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • mRNA stabilization • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of gene expression • cellular response to fatty acid • anoikis • Сперматогенез • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • Клітинний цикл • forebrain development • negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hypoxia • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • Апоптоз • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of G0 to G1 transition • positive regulation of glial cell proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 33.68 – 33.69 Mb
Хр. 2: 154.56 – 154.57 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
E2F1 (англ. E2F transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот , а молекулярна маса — 46 920[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MALAGAPAGG PCAPALEALL GAGALRLLDS SQIVIISAAQ DASAPPAPTG
PAAPAAGPCD PDLLLFATPQ APRPTPSAPR PALGRPPVKR RLDLETDHQY
LAESSGPARG RGRHPGKGVK SPGEKSRYET SLNLTTKRFL ELLSHSADGV
VDLNWAAEVL KVQKRRIYDI TNVLEGIQLI AKKSKNHIQW LGSHTTVGVG
GRLEGLTQDL RQLQESEQQL DHLMNICTTQ LRLLSEDTDS QRLAYVTCQD
LRSIADPAEQ MVMVIKAPPE TQLQAVDSSE NFQISLKSKQ GPIDVFLCPE
ETVGGISPGK TPSQEVTSEE ENRATDSATI VSPPPSSPPS SLTTDPSQSL
LSLEQEPLLS RMGSLRAPVD EDRLSPLVAA DSLLEHVRED FSGLLPEEFI
SLSPPHEALD YHFGLEEGEG IRDLFDCDFG DLTPLDF
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз , транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Neuman E., Sellers W.R.S., McNeil J.A., Lawrence J.B., Kaelin W.G. Jr. (1996). Structure and partial genomic sequence of the human E2F1 gene.. Gene 173 : 163 — 169. PubMed DOI :10.1016/0378-1119(96)00184-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
Johnson D.G., Ohtani K., Nevins J.R. (1994). Autoregulatory control of E2F1 expression in response to positive and negative regulators of cell cycle progression.. Genes Dev. 8 : 1514 — 1525. PubMed DOI :10.1101/gad.8.13.1514
Helin K., Harlow E., Fattaey A. (1993). Inhibition of E2F-1 transactivation by direct binding of the retinoblastoma protein.. Mol. Cell. Biol. 13 : 6501 — 6508. PubMed DOI :10.1128/MCB.13.10.6501
Dynlacht B.D., Flores O., Lees J.A., Harlow E. (1994). Differential regulation of E2F transactivation by cyclin/cdk2 complexes.. Genes Dev. 8 : 1772 — 1786. PubMed DOI :10.1101/gad.8.15.1772
Xu M., Sheppard K.-A., Peng C.-Y., Yee A.S., Piwnica-Worms H. (1994). Cyclin A/CDK2 binds directly to E2F-1 and inhibits the DNA-binding activity of E2F-1/DP-1 by phosphorylation.. Mol. Cell. Biol. 14 : 8420 — 8431. PubMed DOI :10.1128/MCB.14.12.8420
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші