Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
CEBPA
Ідентифікатори
Символи
CEBPA , C/EBP-alpha, CEBP, CCAAT/enhancer binding protein alpha, CCAAT enhancer binding protein alpha
Зовнішні ІД
OMIM : 116897 MGI: 99480 HomoloGene: 3211 GeneCards: CEBPA
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • transcription by RNA polymerase I • myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lithium ion • glucose homeostasis • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • lung development • cytokine-mediated signaling pathway • цикл сечовини • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • mitochondrion organization • embryonic placenta development • cholesterol metabolic process • negative regulation of cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • macrophage differentiation • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of osteoblast differentiation • granulocyte differentiation • regulation of cell population proliferation • brown fat cell differentiation • lipid homeostasis • white fat cell differentiation • inner ear development • liver development • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • positive regulation of transcription by RNA polymerase III • fat cell differentiation • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of DNA-templated transcription, initiation • positive regulation of macrophage activation • positive regulation of inflammatory response • interleukin-6-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 33.3 – 33.3 Mb
Хр. 7: 34.82 – 34.82 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
CEBPA (англ. CCAAT/enhancer binding protein alpha ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот , а молекулярна маса — 37 561[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MESADFYEAE PRPPMSSHLQ SPPHAPSSAA FGFPRGAGPA QPPAPPAAPE
PLGGICEHET SIDISAYIDP AAFNDEFLAD LFQHSRQQEK AKAAVGPTGG
GGGGDFDYPG APAGPGGAVM PGGAHGPPPG YGCAAAGYLD GRLEPLYERV
GAPALRPLVI KQEPREEDEA KQLALAGLFP YQPPPPPPPS HPHPHPPPAH
LAAPHLQFQI AHCGQTTMHL QPGHPTPPPT PVPSPHPAPA LGAAGLPGPG
SALKGLGAAH PDLRASGGSG AGKAKKSVDK NSNEYRVRRE RNNIAVRKSR
DKAKQRNVET QQKVLELTSD NDRLRKRVEQ LSRELDTLRG IFRQLPESSL
VKAMGNCA
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Antonson P., Xanthopoulos K.G. (1995). Molecular cloning, sequence, and expression patterns of the human gene encoding CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP alpha). Biochem. Biophys. Res. Commun . 215 : 106—113. PMID 7575576 DOI :10.1006/bbrc.1995.2439
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Choi B.H., Park G.T., Rho H.M. (1999). Interaction of hepatitis B viral X protein and CCAAT/enhancer-binding protein alpha synergistically activates the hepatitis B viral enhancer II/pregenomic promoter. J. Biol. Chem . 274 : 2858—2865. PMID 9915821 DOI :10.1074/jbc.274.5.2858
Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004). Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity. Genes Dev . 18 : 912—925. PMID 15107404 DOI :10.1101/gad.1183304
Muller C., Calkhoven C.F., Sha X., Leutz A. (2004). The CCAAT enhancer-binding protein alpha (C/EBPalpha) requires a SWI/SNF complex for proliferation arrest. J. Biol. Chem . 279 : 7353—7358. PMID 14660596 DOI :10.1074/jbc.M312709200
Smith M.L., Cavenagh J.D., Lister T.A., Fitzgibbon J. (2004). Mutation of CEBPA in familial acute myeloid leukemia. N. Engl. J. Med . 351 : 2403—2407. PMID 15575056 DOI :10.1056/NEJMoa041331
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші