Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MYCN
Ідентифікатори
Символи
MYCN , MODED, N-myc, NMYC, ODED, bHLHe37, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene neuroblastoma derived homolog, MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor, MYCNsORF, MYCNsPEP
Зовнішні ІД
OMIM : 164840 MGI: 97357 HomoloGene: 3922 GeneCards: MYCN
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Хроматин • клітинне ядро • ядерце
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • transcription by RNA polymerase II • cartilage condensation • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell death • lung development • embryonic digit morphogenesis • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system morphogenesis • negative regulation of astrocyte differentiation • branching morphogenesis of an epithelial tube • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 15.94 – 15.95 Mb
Хр. 12: 12.99 – 12.99 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYCN (англ. MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот , а молекулярна маса — 49 561[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPSCSTSTMP GMICKNPDLE FDSLQPCFYP DEDDFYFGGP DSTPPGEDIW
KKFELLPTPP LSPSRGFAEH SSEPPSWVTE MLLENELWGS PAEEDAFGLG
GLGGLTPNPV ILQDCMWSGF SAREKLERAV SEKLQHGRGP PTAGSTAQSP
GAGAASPAGR GHGGAAGAGR AGAALPAELA HPAAECVDPA VVFPFPVNKR
EPAPVPAAPA SAPAAGPAVA SGAGIAAPAG APGVAPPRPG GRQTSGGDHK
ALSTSGEDTL SDSDDEDDEE EDEEEEIDVV TVEKRRSSSN TKAVTTFTIT
VRPKNAALGP GRAQSSELIL KRCLPIHQQH NYAAPSPYVE SEDAPPQKKI
KSEASPRPLK SVIPPKAKSL SPRNSDSEDS ERRRNHNILE RQRRNDLRSS
FLTLRDHVPE LVKNEKAAKV VILKKATEYV HSLQAEEHQL LLEKEKLQAR
QQQLLKKIEH ARTC
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Stanton L.W., Schwab M., Bishop J.M. (1986). Nucleotide sequence of the human N-myc gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 83 : 1772—1776. PMID 2869488 DOI :10.1073/pnas.83.6.1772
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Stanton L.W., Bishop J.M. (1987). Alternative processing of RNA transcribed from NMYC . Mol. Cell. Biol . 7 : 4266—4272. PMID 3437890 DOI :10.1128/MCB.7.12.4266
Michitsch R.W., Melera P.W. (1985). Nucleotide sequence of the 3' exon of the human N-myc gene. Nucleic Acids Res . 13 : 2545—2558. PMID 2987858 DOI :10.1093/nar/13.7.2545
Secombe J., Li L., Carlos L., Eisenman R.N. (2007). The Trithorax group protein Lid is a trimethyl histone H3K4 demethylase required for dMyc-induced cell growth. Genes Dev . 21 : 537—551. PMID 17311883 DOI :10.1101/gad.1523007
Ibson J.M., Rabbitts P.H. (1988). Sequence of a germ-line N-myc gene and amplification as a mechanism of activation. Oncogene . 2 : 399—402. PMID 2834684
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші