IRF3

IRF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QU6, 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 5JEO, 5JEK, 5JER, 5JEM, 5JEL, 5JEJ
Ідентифікатори
Символи	IRF3, entrez:3661, IIAE7, interferon regulatory factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603734 MGI: 1859179 HomoloGene: 1208 GeneCards: IRF3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • macrophage apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to bacterium • response to exogenous dsRNA • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cellular response to dsRNA • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of type I interferon production • programmed necrotic cell death • GO:0022415 viral process • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of type I interferon production • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of interferon-beta production • вроджений імунітет • regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of defense response to virus by host • регуляція експресії генів • regulation of inflammatory response • cellular response to exogenous dsRNA • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3661	54131
Ensembl	ENSG00000126456	ENSMUSG00000003184
UniProt	Q14653	P70671
RefSeq (мРНК)	NM_001197122 NM_001197123 NM_001197124 NM_001197125 NM_001197126 NM_001197127 NM_001197128 NM_001571	NM_016849
RefSeq (білок)	NP_001184051 NP_001184052 NP_001184053 NP_001184054 NP_001184055 NP_001184056 NP_001184057 NP_001562 NP_001184053.1 NP_001184056.1 NP_001184057.1	NP_058545
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.66 – 49.67 Mb	Хр. 7: 44.65 – 44.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF3 (англ. Interferon regulatory factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 47 219.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTPKPRILP		WLVSQLDLGQ		LEGVAWVNKS		RTRFRIPWKH		GLRQDAQQED
FGIFQAWAEA		TGAYVPGRDK		PDLPTWKRNF		RSALNRKEGL		RLAEDRSKDP
HDPHKIYEFV		NSGVGDFSQP		DTSPDTNGGG		STSDTQEDIL		DELLGNMVLA
PLPDPGPPSL		AVAPEPCPQP		LRSPSLDNPT		PFPNLGPSEN		PLKRLLVPGE
EWEFEVTAFY		RGRQVFQQTI		SCPEGLRLVG		SEVGDRTLPG		WPVTLPDPGM
SLTDRGVMSY		VRHVLSCLGG		GLALWRAGQW		LWAQRLGHCH		TYWAVSEELL
PNSGHGPDGE		VPKDKEGGVF		DLGPFIVDLI		TFTEGSGRSP		RYALWFCVGE
SWPQDQPWTK		RLVMVKVVPT		CLRALVEMAR		VGGASSLENT		VDLHISNSHP
LSLTSDQYKA		YLQDLVEGMD		FQGPGES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Au W.W.-C., Moore P.P.A., Lowther W.W., Juang Y.-T., Pitha P.M. (1995). Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11657—11661. PMID 8524823 DOI:10.1073/pnas.92.25.11657
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. (1998). Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker. Ann. Hum. Genet. 62: 231—234. PMID 9803267 DOI:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x
• Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. (1998). Virus-dependent phosphorylation of the IRF-3 transcription factor regulates nuclear translocation, transactivation potential, and proteasome-mediated degradation. Mol. Cell. Biol. 18: 2986—2996. PMID 9566918 DOI:10.1128/MCB.18.5.2986
• Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. (2000). Regulated nuclear-cytoplasmic localization of interferon regulatory factor 3, a subunit of double-stranded RNA-activated factor 1. Mol. Cell. Biol. 20: 4159—4168. PMID 10805757 DOI:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000
• Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem. 276: 8951—8957. PMID 11124948 DOI:10.1074/jbc.M008717200

Див. також

• Хромосома 19