NANOG

NANOG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KT0
Ідентифікатори
Символи	NANOG, entrez:79923, Nanog, Nanog homeobox
Зовнішні ІД	OMIM: 607937 MGI: 1919200 HomoloGene: 78027 GeneCards: NANOG
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • регуляція експресії генів • регуляція диференціювання клітин • multicellular organism development • диференціація клітин • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • endodermal cell fate specification • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • stem cell population maintenance • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of stem cell proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79923	71950
Ensembl	ENSG00000111704	ENSMUSG00000012396
UniProt	Q9H9S0	Q80Z64
RefSeq (мРНК)	NM_001297698 NM_024865	NM_028016 NM_001289828 NM_001289830 NM_001289831
RefSeq (білок)	NP_001284627 NP_079141	NP_001276757 NP_001276759 NP_001276760 NP_082292
Локус (UCSC)	Хр. 12: 7.79 – 7.8 Mb	Хр. 6: 122.68 – 122.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NANOG (англ. Nanog homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 305 амінокислот, а молекулярна маса — 34 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVDPACPQS		LPCFEASDCK		ESSPMPVICG		PEENYPSLQM		SSAEMPHTET
VSPLPSSMDL		LIQDSPDSST		SPKGKQPTSA		EKSVAKKEDK		VPVKKQKTRT
VFSSTQLCVL		NDRFQRQKYL		SLQQMQELSN		ILNLSYKQVK		TWFQNQRMKS
KRWQKNNWPK		NSNGVTQKAS		APTYPSLYSS		YHQGCLVNPT		GNLPMWSNQT
WNNSTWSNQT		QNIQSWSNHS		WNTQTWCTQS		WNNQAWNSPF		YNCGEESLQS
CMQFQPNSPA		SDLEAALEAA		GEGLNVIQQT		TRYFSTPQTM		DLFLNYSMNM
QPEDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hart A.H., Hartley L., Ibrahim M., Robb L. (2004). Identification, cloning and expression analysis of the pluripotency promoting Nanog genes in mouse and human. Dev. Dyn. 230: 187—198. PMID 15108323 DOI:10.1002/dvdy.20034
• Booth H.A., Holland P.W. (2004). Eleven daughters of NANOG. Genomics. 84: 229—238. PMID 15233988 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.02.014

Див. також

• Хромосома 12