NR1H4

NR1H4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OSH, 3BEJ, 3DCT, 3DCU, 3FLI, 3FXV, 3GD2, 3HC5, 3HC6, 3L1B, 3OKH, 3OKI, 3OLF, 3OMK, 3OMM, 3OOF, 3OOK, 3RUT, 3RUU, 3RVF, 3P88, 3P89, 4OIV, 4WVD, 4QE6, 4QE8
Ідентифікатори
Символи	NR1H4, BAR, FXR, HRR-1, HRR1, RIP14, nuclear receptor subfamily 1 group H member 4, PFIC5
Зовнішні ІД	OMIM: 603826 MGI: 1352464 HomoloGene: 3760 GeneCards: NR1H4
Реагує на сполуку
chenodiol, fexaramine, obeticholic acid, (E)-guggulsterone
nidufexor
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • retinoid X receptor binding • steroid hormone receptor activity • bile acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chenodeoxycholic acid binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • bile acid receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • cellular triglyceride homeostasis • cellular response to organonitrogen compound • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of ammonia assimilation cycle • toll-like receptor 4 signaling pathway • процес імунної системи • histone H3-R17 methylation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of glutamate metabolic process • intracellular bile acid receptor signaling pathway • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of low-density lipoprotein particle clearance • regulation of bile acid biosynthetic process • regulation of cholesterol metabolic process • regulation of urea metabolic process • intracellular receptor signaling pathway • negative regulation of bile acid biosynthetic process • cellular response to fatty acid • bile acid and bile salt transport • nitrogen catabolite activation of transcription from RNA polymerase II promoter • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • inflammatory response • вроджений імунітет • GO:0072468 сигнальна трансдукція • steroid hormone mediated signaling pathway • fatty acid homeostasis • GO:1903106 positive regulation of insulin receptor signaling pathway • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of interleukin-2 production • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • negative regulation of inflammatory response • glucose homeostasis • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of adipose tissue development • cell-cell junction assembly • toll-like receptor 9 signaling pathway • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • bile acid metabolic process • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • defense response to bacterium • negative regulation of interleukin-1 production • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of interleukin-6 production • triglyceride homeostasis • negative regulation of interferon-gamma production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • bile acid signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of phosphatidic acid biosynthetic process • cholesterol homeostasis • lipid metabolism • multicellular organism development • диференціація клітин • lipid homeostasis • cellular glucose homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9971	20186
Ensembl	ENSG00000012504	ENSMUSG00000047638
UniProt	Q96RI1	Q60641
RefSeq (мРНК)	NM_001206977 NM_001206978 NM_001206979 NM_001206992 NM_001206993 NM_005123	NM_001163504 NM_001163700 NM_009108 NM_001385711
RefSeq (білок)	NP_001193906 NP_001193907 NP_001193908 NP_001193921 NP_001193922 NP_005114 NP_001193906.1 NP_001193908.1	NP_001156976 NP_001157172 NP_033134 NP_001372640
Локус (UCSC)	Хр. 12: 100.47 – 100.56 Mb	Хр. 10: 89.29 – 89.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NR1H4 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 55 914.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVMQFQGLEN		PIQISPHCSC		TPSGFFMEMM		SMKPAKGVLT		EQVAGPLGQN
LEVEPYSQYS		NVQFPQVQPQ		ISSSSYYSNL		GFYPQQPEEW		YSPGIYELRR
MPAETLYQGE		TEVAEMPVTK		KPRMGASAGR		IKGDELCVVC		GDRASGYHYN
ALTCEGCKGF		FRRSITKNAV		YKCKNGGNCV		MDMYMRRKCQ		ECRLRKCKEM
GMLAECMYTG		LLTEIQCKSK		RLRKNVKQHA		DQTVNEDSEG		RDLRQVTSTT
KSCREKTELT		PDQQTLLHFI		MDSYNKQRMP		QEITNKILKE		EFSAEENFLI
LTEMATNHVQ		VLVEFTKKLP		GFQTLDHEDQ		IALLKGSAVE		AMFLRSAEIF
NKKLPSGHSD		LLEERIRNSG		ISDEYITPMF		SFYKSIGELK		MTQEEYALLT
AIVILSPDRQ		YIKDREAVEK		LQEPLLDVLQ		KLCKIHQPEN		PQHFACLLGR
LTELRTFNHH		HAEMLMSWRV		NDHKFTPLLC		EIWDVQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kanaya E., Shiraki T., Jingami H. (2004). The nuclear bile acid receptor FXR is activated by PGC-1alpha in a ligand-dependent manner. Biochem. J. 382: 913—921. PMID 15202934 DOI:10.1042/BJ20040432
• Neimark E., Chen F., Li X., Shneider B.L. (2004). Bile acid-induced negative feedback regulation of the human ileal bile acid transporter. Hepatology. 40: 149—156. PMID 15239098 DOI:10.1002/hep.20295
• Pineda Torra I., Freedman L.P., Garabedian M.J. (2004). Identification of DRIP205 as a coactivator for the Farnesoid X receptor. J. Biol. Chem. 279: 36184—36191. PMID 15187081 DOI:10.1074/jbc.M405126200
• Hirokane H., Nakahara M., Tachibana S., Shimizu M., Sato R. (2004). Bile acid reduces the secretion of very low density lipoprotein by repressing microsomal triglyceride transfer protein gene expression mediated by hepatocyte nuclear factor-4. J. Biol. Chem. 279: 45685—45692. PMID 15337761 DOI:10.1074/jbc.M404255200
• Ananthanarayanan M., Li S., Balasubramaniyan N., Suchy F.J., Walsh M.J. (2004). Ligand-dependent activation of the farnesoid X-receptor directs arginine methylation of histone H3 by CARM1. J. Biol. Chem. 279: 54348—54357. PMID 15471871 DOI:10.1074/jbc.M410021200

Див. також

• Хромосома 12