KDM3B

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
KDM3B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи KDM3B, 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, NET22, lysine demethylase 3B
Зовнішні ІД OMIM: 609373 MGI: 1923356 HomoloGene: 41145 GeneCards: KDM3B
Шаблон експресії
PBB GE JMJD1B 201643 x at fs.png

PBB GE JMJD1B 210878 s at fs.png
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_016604
NM_001081256
NM_029518
RefSeq (білок)
NP_057688
NP_001074725
Локус (UCSC) Хр. 5: 138.35 – 138.44 Mb Хр. 18: 34.78 – 34.84 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KDM3B (англ. Lysine demethylase 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 761 амінокислот, а молекулярна маса — 191 581[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAG
TVRAMSGAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAP
REDPVLLQGIRVSIAQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSD
ANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQG
HRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIKSVDPRLIHVM
LMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASK
KLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPSTFVPQI
NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYSTATGQTPLAPEVGG
AENKEAGKTLEQVGQGIVASAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQ
KGSRSQASGENSRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLATEN
KPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADD
SSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKPGSKAGSSVDRKVPAESMPT
LTPAFPRSLLNARTPENHENLFLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFS
SFASQASGSSSSATTVTSKVAPSWPESHSSADSASLAKKKPLFITTDSSK
LVSGVLGSALTSGGPSLSAMGNGRSSSPTSSLTQPIEMPTLSSSPTEERP
TVGPGQQDNPLLKTFSNVFGRHSGGFLSSPADFSQENKAPFEAVKRFSLD
ERSLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSEEQLQAKTGLKGIPEHLMGKLGPNGE
RSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRK
GVLRVEGFLSPQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQ
LVMSEKEAMMMVEPHQKVAWKRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGF
GVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIP
GTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVTNGMSQLPSIN
PSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKE
SHSPFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSG
PGKLPQTPLDTGIPFPPVFSTSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTS
DASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHTSHSWLCDGRLLCLHDPSNKN
NWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGDQDVDLVNCRN
CAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAE
DRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTK
QRIHDGKEKPGALWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQ
SWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV
AEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGT
LKAHESKLARS

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1337 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017. 
  4. UniProt, Q7LBC6 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]