Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
IRX4 (англ. Iroquois homeobox 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот , а молекулярна маса — 54 445[5] .
10 20 30 40 50
MSYPQFGYPY SSAPQFLMAT NSLSTCCESG GRTLADSGPA ASAQAPVYCP
VYESRLLATA RHELNSAAAL GVYGGPYGGS QGYGNYVTYG SEASAFYSLN
SFDSKDGSGS AHGGLAPAAA AYYPYEPALG QYPYDRYGTM DSGTRRKNAT
RETTSTLKAW LQEHRKNPYP TKGEKIMLAI ITKMTLTQVS TWFANARRRL
KKENKMTWPP RNKCADEKRP YAEGEEEEGG EEEAREEPLK SSKNAEPVGK
EEKELELSDL DDFDPLEAEP PACELKPPFH SLDGGLERVP AAPDGPVKEA
SGALRMSLAA GGGAALDEDL ERARSCLRSA AAGPEPLPGA EGGPQVCEAK
LGFVPAGASA GLEAKPRIWS LAHTATAAAA AATSLSQTEF PSCMLKRQGP
AAPAAVSSAP ATSPSVALPH SGALDRHQDS PVTSLRNWVD GVFHDPILRH
STLNQAWATA KGALLDPGPL GRSLGAGANV LTAPLARAFP PAVPQDAPAA
GAARELLALP KAGGKPFCA
Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші