IRX3

IRX3
Ідентифікатори
Символи	IRX3, IRX-1, IRXB1, iroquois homeobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612985 MGI: 1197522 HomoloGene: 7385 GeneCards: IRX3
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • аксон • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • mesoderm development • specification of loop of Henle identity • metanephros development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • proximal/distal pattern formation involved in nephron development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • energy homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79191	16373
Ensembl	ENSG00000177508	ENSMUSG00000031734
UniProt	P78415	P81067
RefSeq (мРНК)	NM_024336	NM_001253822 NM_008393
RefSeq (білок)	NP_077312	NP_001240751 NP_032419
Локус (UCSC)	Хр. 16: 54.28 – 54.29 Mb	Хр. 8: 92.53 – 92.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRX3 (англ. Iroquois homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 52 119.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFPQLGYQY		IRPLYPSERP		GAAGGSGGSA		GARGGLGAGA		SELNASGSLS
NVLSSVYGAP		YAAAAAAAAA		QGYGAFLPYA		AELPIFPQLG		AQYELKDSPG
VQHPAAAAAF		PHPHPAFYPY		GQYQFGDPSR		PKNATRESTS		TLKAWLNEHR
KNPYPTKGEK		IMLAIITKMT		LTQVSTWFAN		ARRRLKKENK		MTWAPRSRTD
EEGNAYGSER		EEEDEEEDEE		DGKRELELEE		EELGGEEEDT		GGEGLADDDE
DEEIDLENLD		GAATEPELSL		AGAARRDGDL		GLGPISDSKN		SDSEDSSEGL
EDRPLPVLSL		APAPPPVAVA		SPSLPSPPVS		LDPCAPAPAP		ASALQKPKIW
SLAETATSPD		NPRRSPPGAG		GSPPGAAVAP		SALQLSPAAA		AAAAHRLVSA
PLGKFPAWTN		RPFPGPPPGP		RLHPLSLLGS		APPHLLGLPG		AAGHPAAAAA
FARPAEPEGG		TDRCSALEVE		KKLLKTAFQP		VPRRPQNHLD		AALVLSALSS
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16