ELK4

ELK4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BC7, 1BC8, 1HBX, 1K6O
Ідентифікатори
Символи	ELK4, SAP1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK4
Зовнішні ІД	OMIM: 600246 MGI: 102853 HomoloGene: 1492 GeneCards: ELK4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • Нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • histone H3 deacetylation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2005	13714
Ensembl	ENSG00000158711	ENSMUSG00000026436
UniProt	P28324	P41158
RefSeq (мРНК)	NM_001973 NM_021795	NM_007923 NM_001376954 NM_001376955 NM_001376956 NM_001376957 NM_001376958 NM_001376959
RefSeq (білок)	NP_001964 NP_068567 NP_068567.1	NP_031949 NP_001363883 NP_001363884 NP_001363885 NP_001363886 NP_001363887 NP_001363888
Локус (UCSC)	Хр. 1: 205.6 – 205.63 Mb	Хр. 1: 131.94 – 131.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ELK4 (англ. ELK4, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 46 900.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSAITLWQF		LLQLLQKPQN		KHMICWTSND		GQFKLLQAEE		VARLWGIRKN
KPNMNYDKLS		RALRYYYVKN		IIKKVNGQKF		VYKFVSYPEI		LNMDPMTVGR
IEGDCESLNF		SEVSSSSKDV		ENGGKDKPPQ		PGAKTSSRND		YIHSGLYSSF
TLNSLNSSNV		KLFKLIKTEN		PAEKLAEKKS		PQEPTPSVIK		FVTTPSKKPP
VEPVAATISI		GPSISPSSEE		TIQALETLVS		PKLPSLEAPT		SASNVMTAFA
TTPPISSIPP		LQEPPRTPSP		PLSSHPDIDT		DIDSVASQPM		ELPENLSLEP
KDQDSVLLEK		DKVNNSSRSK		KPKGLELAPT		LVITSSDPSP		LGILSPSLPT
ASLTPAFFSQ		TPIILTPSPL		LSSIHFWSTL		SPVAPLSPAR		LQGANTLFQF
PSVLNSHGPF		TLSGLDGPST		PGPFSPDLQK		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Dalton S., Treisman R. (1992). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell. 68: 597—612. PMID 1339307 DOI:10.1016/0092-8674(92)90194-H
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mo Y., Vaessen B., Johnston K., Marmorstein R. (1998). Structures of SAP-1 bound to DNA targets from the E74 and c-fos promoters: insights into DNA sequence discrimination by Ets proteins. Mol. Cell. 2: 201—212. PMID 9734357 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80130-6
• Dalton S., Treisman R. (1994). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell. 76: 411—411. PMID 8293474

Див. також

• Хромосома 1