Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NEUROG1
Ідентифікатори
Символи
NEUROG1 , AKA, Math4C, NEUROD3, bHLHa6, ngn1, neurogenin 1
Зовнішні ІД
OMIM : 601726 MGI: 107754 HomoloGene: 4490 GeneCards: NEUROG1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • E-box binding • sequence-specific double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• перикаріон • soma • клітинне ядро
Біологічний процес
• regulation of neuron differentiation • Нейрогенез • диференціація клітин • cell fate commitment • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of exit from mitosis • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • thorax and anterior abdomen determination • trigeminal nerve development • vestibulocochlear nerve formation • перистальтика • auditory behavior • genitalia morphogenesis • inner ear morphogenesis • regulation of muscle organ development • genitalia development • inner ear development • neuromuscular process controlling balance • Жування • cochlea development • cochlea morphogenesis • craniofacial suture morphogenesis • learned vocalization behavior • negative regulation of relaxation of muscle • negative regulation of saliva secretion • hard palate morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 135.53 – 135.54 Mb
Хр. 13: 56.4 – 56.4 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NEUROG1 (англ. Neurogenin 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот , а молекулярна маса — 25 718[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPARLETCIS DLDCASSSGS DLSGFLTDEE DCARLQQAAS ASGPPAPARR
GAPNISRASE VPGAQDDEQE RRRRRGRTRV RSEALLHSLR RSRRVKANDR
ERNRMHNLNA ALDALRSVLP SFPDDTKLTK IETLRFAYNY IWALAETLRL
ADQGLPGGGA RERLLPPQCV PCLPGPPSPA SDAESWGSGA AAASPLSDPS
SPAASEDFTY RPGDPVFSFP SLPKDLLHTT PCFIPYH
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші