GTF2I

GTF2I
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9B, 2DN4, 2ED2, 2EJE
Ідентифікатори
Символи	GTF2I, BAP135, BTKAP1, DIWS, GTFII-I, IB291, SPIN, TFII-I, WBS, WBSCR6, general transcription factor IIi
Зовнішні ІД	OMIM: 601679 MGI: 1202722 HomoloGene: 7748 GeneCards: GTF2I
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mitogen-activated protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • neuronal cell body • cell projection • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of angiogenesis • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration • transition between slow and fast fiber • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2969	14886
Ensembl	ENSG00000263001	ENSMUSG00000060261
UniProt	P78347	Q9ESZ8
RefSeq (мРНК)	NM_001163636 NM_001280800 NM_001518 NM_032999 NM_033000 NM_033001	NM_001080746 NM_001080747 NM_001080748 NM_001080749 NM_010365 NM_001359062 NM_001359063 NM_001359064 NM_001359065 NM_001359066 NM_001359067
RefSeq (білок)	NP_001157108 NP_001267729 NP_001509 NP_127492 NP_127493 NP_127494	NP_001074215 NP_001074216 NP_001074217 NP_001074218 NP_034495 NP_001345991 NP_001345992 NP_001345993 NP_001345994 NP_001345995 NP_001345996
Локус (UCSC)	Хр. 7: 74.65 – 74.76 Mb	Хр. 5: 134.24 – 134.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2I (англ. General transcription factor IIi) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 998 амінокислот, а молекулярна маса — 112 416.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQVAMSTLP		VEDEESSESR		MVVTFLMSAL		ESMCKELAKS		KAEVACIAVY
ETDVFVVGTE		RGRAFVNTRK		DFQKDFVKYC		VEEEEKAAEM		HKMKSTTQAN
RMSVDAVEIE		TLRKTVEDYF		CFCYGKALGK		STVVPVPYEK		MLRDQSAVVV
QGLPEGVAFK		HPENYDLATL		KWILENKAGI		SFIIKRPFLE		PKKHVGGRVM
VTDADRSILS		PGGSCGPIKV		KTEPTEDSGI		SLEMAAVTVK		EESEDPDYYQ
YNIQAGPSET		DDVDEKQPLS		KPLQGSHHSS		EGNEGTEMEV		PAEDSTQHVP
SETSEDPEVE		VTIEDDDYSP		PSKRPKANEL		PQPPVPEPAN		AGKRKVREFN
FEKWNARITD		LRKQVEELFE		RKYAQAIKAK		GPVTIPYPLF		QSHVEDLYVE
GLPEGIPFRR		PSTYGIPRLE		RILLAKERIR		FVIKKHELLN		STREDLQLDK
PASGVKEEWY		ARITKLRKMV		DQLFCKKFAE		ALGSTEAKAV		PYQKFEAHPN
DLYVEGLPEN		IPFRSPSWYG		IPRLEKIIQV		GNRIKFVIKR		PELLTHSTTE
VTQPRTNTPV		KEDWNVRITK		LRKQVEEIFN		LKFAQALGLT		EAVKVPYPVF
ESNPEFLYVE		GLPEGIPFRS		PTWFGIPRLE		RIVRGSNKIK		FVVKKPELVI
SYLPPGMASK		INTKALQSPK		RPRSPGSNSK		VPEIEVTVEG		PNNNNPQTSA
VRTPTQTNGS		NVPFKPRGRE		FSFEAWNAKI		TDLKQKVENL		FNEKCGEALG
LKQAVKVPFA		LFESFPEDFY		VEGLPEGVPF		RRPSTFGIPR		LEKILRNKAK
IKFIIKKPEM		FETAIKESTS		SKSPPRKINS		SPNVNTTASG		VEDLNIIQVT
IPDDDNERLS		KVEKARQLRE		QVNDLFSRKF		GEAIGMGFPV		KVPYRKITIN
PGCVVVDGMP		PGVSFKAPSY		LEISSMRRIL		DSAEFIKFTV		IRPFPGLVIN
NQLVDQSESE		GPVIQESAEP		SQLEVPATEE		IKETDGSSQI		KQEPDPTW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Yang W., Desiderio S. (1997). BAP-135, a target for Bruton's tyrosine kinase in response to B cell receptor engagement. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 604—609. PMID 9012831 DOI:10.1073/pnas.94.2.604
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Egloff A.M., Desiderio S. (2001). Identification of phosphorylation sites for Bruton's tyrosine kinase within the transcriptional regulator BAP/TFII-I. J. Biol. Chem. 276: 27806—27815. PMID 11373296 DOI:10.1074/jbc.M103692200
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 7