NR2E1

NR2E1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4XAJ
Ідентифікатори
Символи	NR2E1, TLL, TLX, XTLL, nuclear receptor subfamily 2 group E member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603849 MGI: 1100526 HomoloGene: 37750 GeneCards: NR2E1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • glial cell migration • cell fate commitment • negative regulation of astrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • somatic stem cell population maintenance • dentate gyrus development • negative regulation of neural precursor cell proliferation • regulation of cellular component organization • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • regulation of timing of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of angiogenesis • anterior commissure morphogenesis • regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation • multicellular organism development • brain development • positive regulation of cell cycle • amygdala development • retina development in camera-type eye • forebrain generation of neurons • layer formation in cerebral cortex • positive regulation of cell population proliferation • cerebral cortex development • соціальна поведінка • cerebral cortex neuron differentiation • regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • camera-type eye development • olfactory bulb development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of stem cell proliferation • aggressive behavior • зір • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • довготривала потенціація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7101	21907
Ensembl	ENSG00000112333	ENSMUSG00000019803
UniProt	Q9Y466	Q64104
RefSeq (мРНК)	NM_001286102 NM_003269	NM_152229
RefSeq (білок)	NP_001273031 NP_003260	NP_689415
Локус (UCSC)	Хр. 6: 108.17 – 108.19 Mb	Хр. 10: 42.44 – 42.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NR2E1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 589.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKPAGSTSR		ILDIPCKVCG		DRSSGKHYGV		YACDGCSGFF		KRSIRRNRTY
VCKSGNQGGC		PVDKTHRNQC		RACRLKKCLE		VNMNKDAVQH		ERGPRTSTIR
KQVALYFRGH		KEENGAAAHF		PSAALPAPAF		FTAVTQLEPH		GLELAAVSTT
PERQTLVSLA		QPTPKYPHEV		NGTPMYLYEV		ATESVCESAA		RLLFMSIKWA
KSVPAFSTLS		LQDQLMLLED		AWRELFVLGI		AQWAIPVDAN		TLLAVSGMNG
DNTDSQKLNK		IISEIQALQE		VVARFRQLRL		DATEFACLKC		IVTFKAVPTH
SGSELRSFRN		AAAIAALQDE		AQLTLNSYIH		TRYPTQPCRF		GKLLLLLPAL
RSISPSTIEE		VFFKKTIGNV		PITRLLSDMY		KSSDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Jackson A., Panayiotidis P., Foroni L. (1998). The human homologue of the Drosophila tailless gene (TLX): characterization and mapping to a region of common deletion in human lymphoid leukemia on chromosome 6q21. Genomics. 50: 34—43. PMID 9628820 DOI:10.1006/geno.1998.5270
• Kobayashi M., Yu R.T., Yasuda K., Umesono K. (2000). Cell-type-specific regulation of the retinoic acid receptor mediated by the orphan nuclear receptor TLX. Mol. Cell. Biol. 20: 8731—8739. PMID 11073974 DOI:10.1128/MCB.20.23.8731-8739.2000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6