Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ETS2
Ідентифікатори
Символи
ETS2 , ETS2IT1, ETS proto-oncogene 2, transcription factor
Зовнішні ІД
OMIM : 164740 MGI: 95456 HomoloGene: 3838 GeneCards: ETS2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • glucocorticoid receptor binding • protein domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинна мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес
• skeletal system development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • ectodermal cell fate commitment • mesoderm development • primitive streak formation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 21: 38.81 – 38.82 Mb
Хр. 16: 95.5 – 95.52 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
ETS2 (англ. ETS proto-oncogene 2, transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот , а молекулярна маса — 53 001[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNDFGIKNMD QVAPVANSYR GTLKRQPAFD TFDGSLFAVF PSLNEEQTLQ
EVPTGLDSIS HDSANCELPL LTPCSKAVMS QALKATFSGF KKEQRRLGIP
KNPWLWSEQQ VCQWLLWATN EFSLVNVNLQ RFGMNGQMLC NLGKERFLEL
APDFVGDILW EHLEQMIKEN QEKTEDQYEE NSHLTSVPHW INSNTLGFGT
EQAPYGMQTQ NYPKGGLLDS MCPASTPSVL SSEQEFQMFP KSRLSSVSVT
YCSVSQDFPG SNLNLLTNNS GTPKDHDSPE NGADSFESSD SLLQSWNSQS
SLLDVQRVPS FESFEDDCSQ SLCLNKPTMS FKDYIQERSD PVEQGKPVIP
AAVLAGFTGS GPIQLWQFLL ELLSDKSCQS FISWTGDGWE FKLADPDEVA
RRWGKRKNKP KMNYEKLSRG LRYYYDKNII HKTSGKRYVY RFVCDLQNLL
GFTPEELHAI LGVQPDTED
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Wasylyk C., Schlumberger S.E., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (2002). Sp100 interacts with ETS-1 and stimulates its transcriptional activity. Mol. Cell. Biol . 22 : 2687—2702. PMID 11909962 DOI :10.1128/MCB.22.8.2687-2702.2002
Watson D.K., Mavrothalassitis G.J., Jorcyk C.L., Smyth F.E., Papas T.S. (1990). Molecular organization and differential polyadenylation sites of the human ETS2 gene. Oncogene . 5 : 1521—1527. PMID 2250910
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші