Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
THRA
Ідентифікатори
Символи
THRA , AR7, CHNG6, EAR7, ERB-T-1, ERBA, ERBA1, NR1A1, THRA1, THRA2, c-ERBA-1, thyroid hormone receptor, alpha, thyroid hormone receptor alpha, TRalpha
Зовнішні ІД
OMIM : 190120 MGI: 98742 HomoloGene: 37747 GeneCards: THRA
Пов'язані генетичні захворювання
congenital nongoitrous hypothryoidism 6 [ 1]
Реагує на сполуку
DL-3,3',5'-triiodothyronine , tiratricol , трийодтиронін , левотироксин [ 2]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • zinc ion binding • chromatin DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • steroid receptor RNA activator RNA binding • transcription factor binding • TBP-class protein binding • steroid hormone receptor activity • DNA binding • protein domain specific binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • thyroid hormone binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to cold • cytoplasmic sequestering of transcription factor • hormone-mediated signaling pathway • regulation of thyroid hormone mediated signaling pathway • thyroid gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • осифікація • female courtship behavior • cartilage condensation • negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • type I pneumocyte differentiation • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid catabolic process • regulation of heart contraction • animal organ morphogenesis • positive regulation of female receptivity • learning or memory • regulation of myeloid cell apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • erythrocyte differentiation • negative regulation of DNA-templated transcription, initiation • positive regulation of myotube differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • thyroid hormone mediated signaling pathway • multicellular organism development • brain development • диференціація клітин • response to lipid • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 40.06 – 40.09 Mb
Хр. 11: 98.63 – 98.66 Mb
PubMed search
[ 3]
[ 4] Вікідані
THRA (англ. Thyroid hormone receptor, alpha ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот , а молекулярна маса — 54 816[ 6] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEQKPSKVEC GSDPEENSAR SPDGKRKRKN GQCSLKTSMS GYIPSYLDKD
EQCVVCGDKA TGYHYRCITC EGCKGFFRRT IQKNLHPTYS CKYDSCCVID
KITRNQCQLC RFKKCIAVGM AMDLVLDDSK RVAKRKLIEQ NRERRRKEEM
IRSLQQRPEP TPEEWDLIHI ATEAHRSTNA QGSHWKQRRK FLPDDIGQSP
IVSMPDGDKV DLEAFSEFTK IITPAITRVV DFAKKLPMFS ELPCEDQIIL
LKGCCMEIMS LRAAVRYDPE SDTLTLSGEM AVKREQLKNG GLGVVSDAIF
ELGKSLSAFN LDDTEVALLQ AVLLMSTDRS GLLCVDKIEK SQEAYLLAFE
HYVNHRKHNI PHFWPKLLMK EREVQSSILY KGAAAEGRPG GSLGVHPEGQ
QLLGMHVVQG PQVRQLEQQL GEAGSLQGPV LQHQSPKSPQ QRLLELLHRS
GILHARAVCG EDDSSEADSP SSSEEEPEVC EDLAGNAASP
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Pfahl M., Benbrook D. (1987). Nucleotide sequence of cDNA encoding a novel human thyroid hormone receptor. Nucleic Acids Res . 15 : 9613—9613. PMID 3684612 DOI :10.1093/nar/15.22.9613
Nakai A., Sakurai A., Bell G.I., Degroot L.J. (1988). Characterization of a third human thyroid hormone receptor coexpressed with other thyroid hormone receptors in several tissues. Mol. Endocrinol . 2 : 1087—1092. PMID 2464749 DOI :10.1210/mend-2-11-1087
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Benbrook D., Pfahl M. (1987). A novel thyroid hormone receptor encoded by a cDNA clone from a human testis library. Science . 238 : 788—791. PMID 3672126 DOI :10.1126/science.3672126
Yang Y.Z., Burgos-Trinidad M., Wu Y., Koenig R.J. (1996). Thyroid hormone receptor variant alpha2. Role of the ninth heptad in dna binding, heterodimerization with retinoid X receptors, and dominant negative activity. J. Biol. Chem . 271 : 28235—28242. PMID 8910441 DOI :10.1074/jbc.271.45.28235
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші