Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOS
Ідентифікатори
Символи
FOS , AP-1, C-p55, Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit
Зовнішні ІД
OMIM : 164810 MGI: 95574 HomoloGene: 3844 GeneCards: FOS
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • R-SMAD binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • transcription regulator complex • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • клітинне ядро • protein-DNA complex • transcription factor AP-1 complex
Біологічний процес
• cellular response to extracellular stimulus • response to muscle stretch • response to immobilization stress • cellular response to calcium ion • response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to light stimulus • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to progesterone • жіноча вагітність • response to corticosterone • response to mechanical stimulus • GO:0010260 старіння людини • positive regulation of osteoclast differentiation • transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • response to gravity • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • response to lipopolysaccharide • сон • cellular response to hormone stimulus • regulation of DNA-binding transcription factor activity • conditioned taste aversion • skeletal muscle cell differentiation • response to cold • response to cAMP • inflammatory response • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • response to toxic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів • cytokine-mediated signaling pathway • cellular response to cadmium ion • positive regulation of neuron death
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 75.28 – 75.28 Mb
Хр. 12: 85.52 – 85.52 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOS (англ. Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот , а молекулярна маса — 40 695[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMFSGFNADY EASSSRCSSA SPAGDSLSYY HSPADSFSSM GSPVNAQDFC
TDLAVSSANF IPTVTAISTS PDLQWLVQPA LVSSVAPSQT RAPHPFGVPA
PSAGAYSRAG VVKTMTGGRA QSIGRRGKVE QLSPEEEEKR RIRRERNKMA
AAKCRNRRRE LTDTLQAETD QLEDEKSALQ TEIANLLKEK EKLEFILAAH
RPACKIPDDL GFPEEMSVAS LDLTGGLPEV ATPESEEAFT LPLLNDPEPK
PSVEPVKSIS SMELKTEPFD DFLFPASSRP SGSETARSVP DMDLSGSFYA
ADWEPLHSGS LGMGPMATEL EPLCTPVVTC TPSCTAYTSS FVFTYPEADS
FPSCAAAHRK GSSSNEPSSD SLSSPTLLAL
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі , ендоплазматичному ретикулумі .
van Straaten F., Mueller R., Curran T., Van Beveren C., Verma I.M. (1983). Complete nucleotide sequence of a human c-onc gene: deduced amino acid sequence of the human c-fos protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 80 : 3183—3187. PMID 6574479 DOI :10.1073/pnas.80.11.3183
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev . 3 : 2083—2090. PMID 2516827 DOI :10.1101/gad.3.12b.2083
Zhang Y., Feng X.H., Derynck R. (1998). Smad3 and Smad4 cooperate with c-Jun/c-Fos to mediate TGF-beta-induced transcription. Nature . 394 : 909—913. PMID 9732876 DOI :10.1038/29814
Murphy L.O., Smith S., Chen R.H., Fingar D.C., Blenis J. (2002). Molecular interpretation of ERK signal duration by immediate early gene products. Nat. Cell Biol . 4 : 556—564. PMID 12134156 DOI :10.1038/ncb822
Portal M.M., Ferrero G.O., Caputto B.L. (2007). N-Terminal c-Fos tyrosine phosphorylation regulates c-Fos/ER association and c-Fos-dependent phospholipid synthesis activation. Oncogene . 26 : 3551—3558. PMID 17160021 DOI :10.1038/sj.onc.1210137
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші