Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR2F6
Ідентифікатори
Символи
NR2F6 , EAR-2, EAR2, ERBAL2, nuclear receptor subfamily 2 group F member 6
Зовнішні ІД
OMIM : 132880 MGI: 1352453 HomoloGene: 7706 GeneCards: NR2F6
Онтологія гена
Молекулярна функція
• зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • zinc ion binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • entrainment of circadian clock by photoperiod • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 17.23 – 17.25 Mb
Хр. 8: 71.83 – 71.83 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NR2F6 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group F member 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот , а молекулярна маса — 42 979[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMVTGGWGG PGGDTNGVDK AGGYPRAAED DSASPPGAAS DAEPGDEERP
GLQVDCVVCG DKSSGKHYGV FTCEGCKSFF KRSIRRNLSY TCRSNRDCQI
DQHHRNQCQY CRLKKCFRVG MRKEAVQRGR IPHSLPGAVA ASSGSPPGSA
LAAVASGGDL FPGQPVSELI AQLLRAEPYP AAAGRFGAGG GAAGAVLGID
NVCELAARLL FSTVEWARHA PFFPELPVAD QVALLRLSWS ELFVLNAAQA
ALPLHTAPLL AAAGLHAAPM AAERAVAFMD QVRAFQEQVD KLGRLQVDSA
EYGCLKAIAL FTPDACGLSD PAHVESLQEK AQVALTEYVR AQYPSQPQRF
GRLLLRLPAL RAVPASLISQ LFFMRLVGKT PIETLIRDML LSGSTFNWPY
GSGQ
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , рецепторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Zhang Y., Dufau M.L. (2000). Nuclear orphan receptors regulate transcription of the gene for the human luteinizing hormone receptor. J. Biol. Chem . 275 : 2763—2770. PMID 10644740 DOI :10.1074/jbc.275.4.2763
Zhang Y., Dufau M.L. (2001). EAR2 and EAR3/COUP-TFI regulate transcription of the rat LH receptor. Mol. Endocrinol . 15 : 1891—1905. PMID 11682620 DOI :10.1210/mend.15.11.0720
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші