Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ESR2
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
4J26 , 1L2J , 1NDE , 1QKM , 1U3Q , 1U3R , 1U3S , 1U9E , 1X76 , 1X78 , 1X7B , 1X7J , 1YY4 , 1YYE , 1ZAF , 2FSZ , 2GIU , 2I0G , 2JJ3 , 2NV7 , 2QTU , 2YJD , 2YLY , 2Z4B , 3OLL , 3OLS , 3OMO , 3OMP , 3OMQ , 4J24 , 4ZI1
Ідентифікатори
Символи
ESR2 , ER-BETA, ESR-BETA, ESRB, ESTRB, Erb, NR3A2, estrogen receptor 2, ODG8
Зовнішні ІД
OMIM : 601663 MGI: 109392 HomoloGene: 1100 GeneCards: ESR2
Реагує на сполуку
Естрадіол , діетилстільбестрол , estriol , estrone , ethinylestradiol , Геністейн , тамоксифен , Бісфенол А , lasofoxifene , bazedoxifene , raloxifene , fosfestrol , acolbifene , erteberel , estramustine phosphate sodium , droloxifene [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • steroid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • receptor antagonist activity • lipid binding • enzyme binding • estrogen response element binding • core promoter sequence-specific DNA binding • estrogen receptor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • extracellular region
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • cell-cell signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • extracellular negative regulation of signal transduction • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to estradiol stimulus • negative regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 64.08 – 64.34 Mb
Хр. 12: 76.17 – 76.22 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
ESR2 (англ. Estrogen receptor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот , а молекулярна маса — 59 216[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDIKNSPSSL NSPSSYNCSQ SILPLEHGSI YIPSSYVDSH HEYPAMTFYS
PAVMNYSIPS NVTNLEGGPG RQTTSPNVLW PTPGHLSPLV VHRQLSHLYA
EPQKSPWCEA RSLEHTLPVN RETLKRKVSG NRCASPVTGP GSKRDAHFCA
VCSDYASGYH YGVWSCEGCK AFFKRSIQGH NDYICPATNQ CTIDKNRRKS
CQACRLRKCY EVGMVKCGSR RERCGYRLVR RQRSADEQLH CAGKAKRSGG
HAPRVRELLL DALSPEQLVL TLLEAEPPHV LISRPSAPFT EASMMMSLTK
LADKELVHMI SWAKKIPGFV ELSLFDQVRL LESCWMEVLM MGLMWRSIDH
PGKLIFAPDL VLDRDEGKCV EGILEIFDML LATTSRFREL KLQHKEYLCV
KAMILLNSSM YPLVTATQDA DSSRKLAHLL NAVTDALVWV IAKSGISSQQ
QSMRLANLLM LLSHVRHASN KGMEHLLNMK CKNVVPVYDL LLEMLNAHVL
RGCKSSITGS ECSPAEDSKS KEGSQNPQSQ
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ліпідами , іонами металів, іоном цинку , ДНК , стероїдами .
Локалізований у ядрі .
Література
Leung Y.K., Mak P., Hassan S., Ho S.M. (2006). Estrogen receptor (ER)-beta isoforms: a key to understanding ER-beta signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 103 : 13162—13167. PMID 16938840 DOI :10.1073/pnas.0605676103
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Li L.C., Yeh C.C., Nojima D., Dahiya R. (2000). Cloning and characterization of human estrogen receptor beta promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun . 275 : 682—689. PMID 10964723 DOI :10.1006/bbrc.2000.3363
Mosselman S., Polman J., Dijkema R. (1996). ER beta: identification and characterization of a novel human estrogen receptor. FEBS Lett . 392 : 49—53. PMID 8769313 DOI :10.1016/0014-5793(96)00782-X
Pace P., Taylor J., Suntharalingam S., Coombes R.C., Ali S. (1997). Human estrogen receptor beta binds DNA in a manner similar to and dimerizes with estrogen receptor alpha. J. Biol. Chem . 272 : 25832—25838. PMID 9325313 DOI :10.1074/jbc.272.41.25832
Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000). Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator. J. Biol. Chem . 275 : 5308—5317. PMID 10681503 DOI :10.1074/jbc.275.8.5308
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші