Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ATF6B
Ідентифікатори
Символи
ATF6B , CREB-RP, CREBL1, G13, activating transcription factor 6 beta
Зовнішні ІД
OMIM : 600984 MGI: 105121 HomoloGene: 31238 GeneCards: ATF6B
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cAMP response element binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • integral component of endoplasmic reticulum membrane • protein-DNA complex • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • система ендомембран • ядерце • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Відповідь на незгорнуті білки • ATF6-mediated unfolded protein response • response to unfolded protein • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of ATF6-mediated unfolded protein response
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 32.12 – 32.13 Mb
Хр. 17: 34.87 – 34.87 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ATF6B (англ. Activating transcription factor 6 beta ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот , а молекулярна маса — 76 709[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAELMLLSEI ADPTRFFTDN LLSPEDWGLQ NSTLYSGLDE VAEEQTQLFR
CPEQDVPFDG SSLDVGMDVS PSEPPWELLP IFPDLQVKSE PSSPCSSSSL
SSESSRLSTE PSSEALGVGE VLHVKTESLA PPLCLLGDDP TSSFETVQIN
VIPTSDDSSD VQTKIEPVSP CSSVNSEASL LSADSSSQAF IGEEVLEVKT
ESLSPSGCLL WDVPAPSLGA VQISMGPSLD GSSGKALPTR KPPLQPKPVV
LTTVPMPSRA VPPSTTVLLQ SLVQPPPVSP VVLIQGAIRV QPEGPAPSLP
RPERKSIVPA PMPGNSCPPE VDAKLLKRQQ RMIKNRESAC QSRRKKKEYL
QGLEARLQAV LADNQQLRRE NAALRRRLEA LLAENSELKL GSGNRKVVCI
MVFLLFIAFN FGPVSISEPP SAPISPRMNK GEPQPRRHLL GFSEQEPVQG
VEPLQGSSQG PKEPQPSPTD QPSFSNLTAF PGGAKELLLR DLDQLFLSSD
CRHFNRTESL RLADELSGWV QRHQRGRRKI PQRAQERQKS QPRKKSPPVK
AVPIQPPGPP ERDSVGQLQL YRHPDRSQPA FLDAIDRRED TFYVVSFRRD
HLLLPAISHN KTSRPKMSLV MPAMAPNETL SGRGAPGDYE EMMQIECEVM
DTRVIHIKTS TVPPSLRKQP SPTPGNATGG PLPVSAASQA HQASHQPLYL
NHP
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі , мембрані, ендоплазматичному ретикулумі .
Khanna A., Campbell R.D. (1996). The gene G13 in the class III region of the human MHC encodes a potential DNA-binding protein. Biochem. J . 319 : 81—89. PMID 8870652 DOI :10.1042/bj3190081
Speek M., Barry F., Miller W.L. (1996). Alternate promoters and alternate splicing of human tenascin-X, a gene with 5' and 3' ends buried in other genes. Hum. Mol. Genet . 5 : 1749—1758. PMID 8923003 DOI :10.1093/hmg/5.11.1749
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші