Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MYC
Ідентифікатори
Символи
MYC , MRTL, MYCC, bHLHe39, c-Myc, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene homolog, MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor, Genes, myc, c-myc
Зовнішні ІД
OMIM : 190080 MGI: 97250 HomoloGene: 31092 GeneCards: MYC
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • ремоделювання хроматину • negative regulation of monocyte differentiation • positive regulation of metanephric cap mesenchymal cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of telomere maintenance • positive regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of fibroblast proliferation • cellular response to UV • oxygen transport • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • MAPK cascade • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • branching involved in ureteric bud morphogenesis • negative regulation of cell division • fibroblast apoptotic process • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • positive regulation of response to DNA damage stimulus • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of DNA biosynthetic process • регуляція експресії генів • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of stress-activated MAPK cascade • energy reserve metabolic process • response to growth factor • response to gamma radiation • negative regulation of fibroblast proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular iron ion homeostasis • beta-catenin-TCF complex assembly • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of telomerase activity • GO:1901313 positive regulation of gene expression • protein-DNA complex disassembly • ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to hypoxia • G1/S transition of mitotic cell cycle • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA methylation
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 8: 127.74 – 127.74 Mb
Хр. 15: 61.86 – 61.86 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYC (англ. MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor ) – сім'я регуляторних генів та прото-онкогенів, які кодують однойменні фактори транскрипції. Сімейство Myc складається з трьох споріднених генів людини: c-myc, l-myc і n-myc. c-myc був першим геном, виявленим у цій родині, завдяки гомології з вірусним геном v-myc. При раку c-myc часто виражається конститутивно. Розташований у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот , а молекулярна маса — 48 804[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPLNVSFTNR NYDLDYDSVQ PYFYCDEEEN FYQQQQQSEL QPPAPSEDIW
KKFELLPTPP LSPSRRSGLC SPSYVAVTPF SLRGDNDGGG GSFSTADQLE
MVTELLGGDM VNQSFICDPD DETFIKNIII QDCMWSGFSA AAKLVSEKLA
SYQAARKDSG SPNPARGHSV CSTSSLYLQD LSAAASECID PSVVFPYPLN
DSSSPKSCAS QDSSAFSPSS DSLLSSTESS PQGSPEPLVL HEETPPTTSS
DSEEEQEDEE EIDVVSVEKR QAPGKRSESG SPSAGGHSKP PHSPLVLKRC
HVSTHQHNYA APPSTRKDYP AAKRVKLDSV RVLRQISNNR KCTSPRSSDT
EENVKRRTHN VLERQRRNEL KRSFFALRDQ IPELENNEKA PKVVILKKAT
AYILSVQAEE QKLISEEDLL RKRREQLKHK LEQLRNSCA
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Colby W.W., Chen E.Y., Smith D.H., Levinson A.D. (1983). Identification and nucleotide sequence of a human locus homologous to the v-myc oncogene of avian myelocytomatosis virus MC29. Nature . 301 : 722—725. PMID 6298632 DOI :10.1038/301722a0
Rabbitts T.H., Hamlyn P.H., Baer R. (1983). Altered nucleotide sequences of a translocated c-myc gene in Burkitt lymphoma. Nature . 306 : 760—765. PMID 6419122 DOI :10.1038/306760a0
Watson D.K., Psallidopoulos M.C., Samuel K.P., Dalla-Favera R., Papas T.S. (1983). Nucleotide sequence analysis of human c-myc locus, chicken homologue, and myelocytomatosis virus MC29 transforming gene reveals a highly conserved gene product. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 80 : 3642—3645. PMID 6304729 DOI :10.1073/pnas.80.12.3642
Rabbitts T.H., Forster A., Hamlyn P., Baer R. (1984). Effect of somatic mutation within translocated c-myc genes in Burkitt's lymphoma. Nature . 309 : 592—597. PMID 6547209 DOI :10.1038/309592a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Bentley D.L., Groudine M. (1986). Novel promoter upstream of the human c-myc gene and regulation of c-myc expression in B-cell lymphomas . Mol. Cell. Biol . 6 : 3481—3489. PMID 3540591 DOI :10.1128/MCB.6.10.3481
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші