TAF1

TAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EQF, 3AAD, 3UV4, 3UV5, 4RGW, 4YYM, 4YYN, 5I29, 5I1Q, 5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF1, BA2R, CCG1, CCGS, DYT3, DYT3/KAT4, N-NSCL2, OF, P250, TAF(II)250, TAF2A, TAFII-250, TAFII250, XDP, MRXS33, TATA-box binding protein associated factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 313650 MGI: 1336878 HomoloGene: 37942 GeneCards: TAF1
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked dystonia-parkinsonism
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • p53 binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lysine-acetylated histone binding • TBP-class protein binding • acyltransferase activity • ATP binding • protein serine/threonine kinase activity • histone acetyltransferase activity • kinase activity • protein heterodimerization activity • H3K27me3 modified histone binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • acetyl-CoA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • MLL1 complex • клітинне ядро • ядерце • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex Біологічний процес • фосфорилювання • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • DNA-templated transcription, initiation • protein autophosphorylation • клітинний цикл • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0022415 viral process • histone acetylation • protein polyubiquitination • protein phosphorylation • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of gene expression • midbrain development • positive regulation of protein binding • cellular response to UV • transcription factor catabolic process • protein stabilization • regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • cellular response to ATP • regulation of cell cycle G1/S phase transition • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • negative regulation of protein autoubiquitination • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of androgen receptor activity • positive regulation of transcription by RNA polymerase I • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6872	270627
Ensembl	ENSG00000147133	ENSMUSG00000031314
UniProt	P21675	Q80UV9
RefSeq (мРНК)	NM_001286074 NM_004606 NM_138923	NM_001081008 NM_001290729
RefSeq (білок)	NP_001273003 NP_004597 NP_620278	NP_001277658 NP_001392888 NP_001392889 NP_001392890 NP_001392891
Локус (UCSC)	Хр. X: 71.37 – 71.53 Mb	Хр. X: 100.58 – 100.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF1 (англ. TATA-box binding protein associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 872 амінокислот, а молекулярна маса — 212 677.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPGCDLLLR		TAATITAAAI		MSDTDSDEDS		AGGGPFSLAG		FLFGNINGAG
QLEGESVLDD		ECKKHLAGLG		ALGLGSLITE		LTANEELTGT		DGALVNDEGW
VRSTEDAVDY		SDINEVAEDE		SRRYQQTMGS		LQPLCHSDYD		EDDYDADCED
IDCKLMPPPP		PPPGPMKKDK		DQDSITGEKV		DFSSSSDSES		EMGPQEATQA
ESEDGKLTLP		LAGIMQHDAT		KLLPSVTELF		PEFRPGKVLR		FLRLFGPGKN
VPSVWRSARR		KRKKKHRELI		QEEQIQEVEC		SVESEVSQKS		LWNYDYAPPP
PPEQCLSDDE		ITMMAPVESK		FSQSTGDIDK		VTDTKPRVAE		WRYGPARLWY
DMLGVPEDGS		GFDYGFKLRK		TEHEPVIKSR		MIEEFRKLEE		NNGTDLLADE
NFLMVTQLHW		EDDIIWDGED		VKHKGTKPQR		ASLAGWLPSS		MTRNAMAYNV
QQGFAATLDD		DKPWYSIFPI		DNEDLVYGRW		EDNIIWDAQA		MPRLLEPPVL
TLDPNDENLI		LEIPDEKEEA		TSNSPSKESK		KESSLKKSRI		LLGKTGVIKE
EPQQNMSQPE		VKDPWNLSND		EYYYPKQQGL		RGTFGGNIIQ		HSIPAVELRQ
PFFPTHMGPI		KLRQFHRPPL		KKYSFGALSQ		PGPHSVQPLL		KHIKKKAKMR
EQERQASGGG		EMFFMRTPQD		LTGKDGDLIL		AEYSEENGPL		MMQVGMATKI
KNYYKRKPGK		DPGAPDCKYG		ETVYCHTSPF		LGSLHPGQLL		QAFENNLFRA
PIYLHKMPET		DFLIIRTRQG		YYIRELVDIF		VVGQQCPLFE		VPGPNSKRAN
THIRDFLQVF		IYRLFWKSKD		RPRRIRMEDI		KKAFPSHSES		SIRKRLKLCA
DFKRTGMDSN		WWVLKSDFRL		PTEEEIRAMV		SPEQCCAYYS		MIAAEQRLKD
AGYGEKSFFA		PEEENEEDFQ		MKIDDEVRTA		PWNTTRAFIA		AMKGKCLLEV
TGVADPTGCG		EGFSYVKIPN		KPTQQKDDKE		PQPVKKTVTG		TDADLRRLSL
KNAKQLLRKF		GVPEEEIKKL		SRWEVIDVVR		TMSTEQARSG		EGPMSKFARG
SRFSVAEHQE		RYKEECQRIF		DLQNKVLSST		EVLSTDTDSS		SAEDSDFEEM
GKNIENMLQN		KKTSSQLSRE		REEQERKELQ		RMLLAAGSAA		SGNNHRDDDT
ASVTSLNSSA		TGRCLKIYRT		FRDEEGKEYV		RCETVRKPAV		IDAYVRIRTT
KDEEFIRKFA		LFDEQHREEM		RKERRRIQEQ		LRRLKRNQEK		EKLKGPPEKK
PKKMKERPDL		KLKCGACGAI		GHMRTNKFCP		LYYQTNAPPS		NPVAMTEEQE
EELEKTVIHN		DNEELIKVEG		TKIVLGKQLI		ESADEVRRKS		LVLKFPKQQL
PPKKKRRVGT		TVHCDYLNRP		HKSIHRRRTD		PMVTLSSILE		SIINDMRDLP
NTYPFHTPVN		AKVVKDYYKI		ITRPMDLQTL		RENVRKRLYP		SREEFREHLE
LIVKNSATYN		GPKHSLTQIS		QSMLDLCDEK		LKEKEDKLAR		LEKAINPLLD
DDDQVAFSFI		LDNIVTQKMM		AVPDSWPFHH		PVNKKFVPDY		YKVIVNPMDL
ETIRKNISKH		KYQSRESFLD		DVNLILANSV		KYNGPESQYT		KTAQEIVNVC
YQTLTEYDEH		LTQLEKDICT		AKEAALEEAE		LESLDPMTPG		PYTPQPPDLY
DTNTSLSMSR		DASVFQDESN		MSVLDIPSAT		PEKQVTQEGE		DGDGDLADEE
EGTVQQPQAS		VLYEDLLMSE		GEDDEEDAGS		DEEGDNPFSA		IQLSESGSDS
DVGSGGIRPK		QPRMLQENTR		MDMENEESMM		SYEGDGGEAS		HGLEDSNISY
GSYEEPDPKS		NTQDTSFSSI		GGYEVSEEEE		DEEEEEQRSG		PSVLSQVHLS
EDEEDSEDFH		SIAGDSDLDS		DE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Sekiguchi T., Nohiro Y., Nakamura Y., Hisamoto N., Nishimoto T. (1991). The human CCG1 gene, essential for progression of the G1 phase, encodes a 210-kilodalton nuclear DNA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 11: 3317—3325. PMID 2038334 DOI:10.1128/MCB.11.6.3317
• Ruppert S., Wang E.H., Tjian R. (1993). Cloning and expression of human TAFII250: a TBP-associated factor implicated in cell-cycle regulation. Nature. 362: 175—179. PMID 7680771 DOI:10.1038/362175a0
• Nolte D., Niemann S., Muller U. (2003). Specific sequence changes in multiple transcript system DYT3 are associated with X-linked dystonia parkinsonism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10347—10352. PMID 12928496 DOI:10.1073/pnas.1831949100
• Herzfeld T., Nolte D., Muller U. (2007). Structural and functional analysis of the human TAF1/DYT3 multiple transcript system. Mamm. Genome. 18: 787—795. PMID 17952504 DOI:10.1007/s00335-007-9063-z
• Dikstein R., Ruppert S., Tjian R. (1996). TAFII250 is a bipartite protein kinase that phosphorylates the base transcription factor RAP74. Cell. 84: 781—790. PMID 8625415 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81055-7
• Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 DOI:10.1101/gad.10.11.1369

Див. також

• Хромосома X